Protein–RNA interactions for Protein: Q14676

MDC1, Mediator of DNA damage checkpoint protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDC1Q14676 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MDC1Q14676 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MDC1Q14676 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MDC1Q14676 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
MDC1Q14676 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MDC1Q14676 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MDC1Q14676 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MDC1Q14676 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MDC1Q14676 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
MDC1Q14676 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
MDC1Q14676 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
MDC1Q14676 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
MDC1Q14676 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
MDC1Q14676 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MDC1Q14676 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
MDC1Q14676 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
MDC1Q14676 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
MDC1Q14676 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MDC1Q14676 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
MDC1Q14676 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
MDC1Q14676 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
MDC1Q14676 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
MDC1Q14676 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
MDC1Q14676 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MDC1Q14676 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MDC1Q14676 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MDC1Q14676 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MDC1Q14676 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MDC1Q14676 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MDC1Q14676 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
MDC1Q14676 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
MDC1Q14676 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
MDC1Q14676 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
MDC1Q14676 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MDC1Q14676 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MDC1Q14676 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MDC1Q14676 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
MDC1Q14676 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MDC1Q14676 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MDC1Q14676 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MDC1Q14676 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
MDC1Q14676 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MDC1Q14676 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MDC1Q14676 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
MDC1Q14676 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
MDC1Q14676 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
MDC1Q14676 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
MDC1Q14676 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
MDC1Q14676 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MDC1Q14676 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MDC1Q14676 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MDC1Q14676 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
MDC1Q14676 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
MDC1Q14676 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MDC1Q14676 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
MDC1Q14676 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MDC1Q14676 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MDC1Q14676 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MDC1Q14676 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MDC1Q14676 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
MDC1Q14676 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
MDC1Q14676 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
MDC1Q14676 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MDC1Q14676 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
MDC1Q14676 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
MDC1Q14676 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
MDC1Q14676 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
MDC1Q14676 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
MDC1Q14676 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MDC1Q14676 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MDC1Q14676 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
MDC1Q14676 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MDC1Q14676 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MDC1Q14676 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MDC1Q14676 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
MDC1Q14676 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
MDC1Q14676 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MDC1Q14676 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
MDC1Q14676 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MDC1Q14676 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MDC1Q14676 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MDC1Q14676 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MDC1Q14676 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MDC1Q14676 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MDC1Q14676 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MDC1Q14676 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MDC1Q14676 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MDC1Q14676 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MDC1Q14676 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MDC1Q14676 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
MDC1Q14676 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MDC1Q14676 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MDC1Q14676 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MDC1Q14676 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
MDC1Q14676 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
MDC1Q14676 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MDC1Q14676 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MDC1Q14676 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MDC1Q14676 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MDC1Q14676 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
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