Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC40.93■■■■■ 4.14
NEUROD1Q13562 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
NEUROD1Q13562 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.91■■■■■ 4.14
NEUROD1Q13562 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
NEUROD1Q13562 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC40.87■■■■■ 4.13
NEUROD1Q13562 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.87■■■■■ 4.13
NEUROD1Q13562 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.86■■■■■ 4.13
NEUROD1Q13562 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
NEUROD1Q13562 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC40.84■■■■■ 4.13
NEUROD1Q13562 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC40.84■■■■■ 4.13
NEUROD1Q13562 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
NEUROD1Q13562 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.13
NEUROD1Q13562 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC40.82■■■■■ 4.13
NEUROD1Q13562 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC40.82■■■■■ 4.12
NEUROD1Q13562 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
NEUROD1Q13562 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.78■■■■■ 4.12
NEUROD1Q13562 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.77■■■■■ 4.12
NEUROD1Q13562 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC40.76■■■■■ 4.12
NEUROD1Q13562 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.73■■■■■ 4.11
NEUROD1Q13562 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC40.72■■■■■ 4.11
NEUROD1Q13562 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC40.72■■■■■ 4.11
NEUROD1Q13562 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.7■■■■■ 4.11
NEUROD1Q13562 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
NEUROD1Q13562 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
NEUROD1Q13562 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.63■■■■■ 4.1
NEUROD1Q13562 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC40.62■■■■■ 4.09
NEUROD1Q13562 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
NEUROD1Q13562 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC40.57■■■■■ 4.08
NEUROD1Q13562 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
NEUROD1Q13562 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC40.56■■■■■ 4.08
NEUROD1Q13562 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
NEUROD1Q13562 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC40.55■■■■■ 4.08
NEUROD1Q13562 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.54■■■■■ 4.08
NEUROD1Q13562 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.54■■■■■ 4.08
NEUROD1Q13562 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
NEUROD1Q13562 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC40.51■■■■■ 4.07
NEUROD1Q13562 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC40.5■■■■■ 4.07
NEUROD1Q13562 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
NEUROD1Q13562 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
NEUROD1Q13562 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC40.45■■■■■ 4.07
NEUROD1Q13562 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC40.45■■■■■ 4.07
NEUROD1Q13562 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC40.44■■■■■ 4.06
NEUROD1Q13562 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC40.43■■■■■ 4.06
NEUROD1Q13562 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
NEUROD1Q13562 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
NEUROD1Q13562 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
NEUROD1Q13562 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
NEUROD1Q13562 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
NEUROD1Q13562 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
NEUROD1Q13562 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC40.35■■■■■ 4.05
NEUROD1Q13562 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC40.35■■■■■ 4.05
NEUROD1Q13562 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC40.34■■■■■ 4.05
NEUROD1Q13562 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
NEUROD1Q13562 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC40.33■■■■■ 4.05
NEUROD1Q13562 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.04
NEUROD1Q13562 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.04
NEUROD1Q13562 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC40.31■■■■■ 4.04
NEUROD1Q13562 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC40.3■■■■■ 4.04
NEUROD1Q13562 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
NEUROD1Q13562 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC40.29■■■■■ 4.04
NEUROD1Q13562 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
NEUROD1Q13562 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC40.28■■■■■ 4.04
NEUROD1Q13562 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
NEUROD1Q13562 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.03
NEUROD1Q13562 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
NEUROD1Q13562 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
NEUROD1Q13562 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC40.2■■■■■ 4.03
NEUROD1Q13562 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
NEUROD1Q13562 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC40.18■■■■■ 4.02
NEUROD1Q13562 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.14■■■■■ 4.02
NEUROD1Q13562 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC40.13■■■■■ 4.01
NEUROD1Q13562 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC40.13■■■■■ 4.01
NEUROD1Q13562 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.01
NEUROD1Q13562 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC40.12■■■■■ 4.01
NEUROD1Q13562 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
NEUROD1Q13562 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
NEUROD1Q13562 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4.01
NEUROD1Q13562 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC40.06■■■■■ 4
NEUROD1Q13562 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC40.06■■■■■ 4
NEUROD1Q13562 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
NEUROD1Q13562 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
NEUROD1Q13562 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC40.03■■■■■ 4
NEUROD1Q13562 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.01■■■■■ 4
NEUROD1Q13562 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.01■■■■■ 4
NEUROD1Q13562 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
NEUROD1Q13562 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
NEUROD1Q13562 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
NEUROD1Q13562 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC40■■■■□ 3.99
NEUROD1Q13562 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
NEUROD1Q13562 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
NEUROD1Q13562 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC39.96■■■■□ 3.99
NEUROD1Q13562 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
NEUROD1Q13562 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
NEUROD1Q13562 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
NEUROD1Q13562 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC39.92■■■■□ 3.98
NEUROD1Q13562 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC39.91■■■■□ 3.98
NEUROD1Q13562 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
NEUROD1Q13562 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC39.9■■■■□ 3.98
NEUROD1Q13562 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC39.89■■■■□ 3.98
NEUROD1Q13562 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
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