Protein–RNA interactions for Protein: Q13351

KLF1, Krueppel-like factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 362 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF1Q13351 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
KLF1Q13351 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
KLF1Q13351 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
KLF1Q13351 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
KLF1Q13351 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
KLF1Q13351 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
KLF1Q13351 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
KLF1Q13351 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
KLF1Q13351 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
KLF1Q13351 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
KLF1Q13351 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
KLF1Q13351 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
KLF1Q13351 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
KLF1Q13351 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
KLF1Q13351 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
KLF1Q13351 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
KLF1Q13351 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
KLF1Q13351 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
KLF1Q13351 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
KLF1Q13351 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
KLF1Q13351 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
KLF1Q13351 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
KLF1Q13351 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
KLF1Q13351 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
KLF1Q13351 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
KLF1Q13351 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
KLF1Q13351 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
KLF1Q13351 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
KLF1Q13351 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
KLF1Q13351 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
KLF1Q13351 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
KLF1Q13351 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
KLF1Q13351 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
KLF1Q13351 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
KLF1Q13351 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
KLF1Q13351 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
KLF1Q13351 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
KLF1Q13351 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
KLF1Q13351 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
KLF1Q13351 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
KLF1Q13351 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
KLF1Q13351 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
KLF1Q13351 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
KLF1Q13351 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
KLF1Q13351 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
KLF1Q13351 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
KLF1Q13351 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
KLF1Q13351 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
KLF1Q13351 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
KLF1Q13351 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
KLF1Q13351 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
KLF1Q13351 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
KLF1Q13351 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
KLF1Q13351 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
KLF1Q13351 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
KLF1Q13351 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
KLF1Q13351 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
KLF1Q13351 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
KLF1Q13351 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
KLF1Q13351 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
KLF1Q13351 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
KLF1Q13351 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
KLF1Q13351 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
KLF1Q13351 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
KLF1Q13351 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
KLF1Q13351 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
KLF1Q13351 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
KLF1Q13351 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
KLF1Q13351 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
KLF1Q13351 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
KLF1Q13351 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
KLF1Q13351 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
KLF1Q13351 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
KLF1Q13351 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
KLF1Q13351 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
KLF1Q13351 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
KLF1Q13351 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
KLF1Q13351 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
KLF1Q13351 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
KLF1Q13351 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
KLF1Q13351 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
KLF1Q13351 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
KLF1Q13351 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
KLF1Q13351 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
KLF1Q13351 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
KLF1Q13351 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
KLF1Q13351 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
KLF1Q13351 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
KLF1Q13351 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
KLF1Q13351 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
KLF1Q13351 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
KLF1Q13351 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
KLF1Q13351 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
KLF1Q13351 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
KLF1Q13351 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
KLF1Q13351 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
KLF1Q13351 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
KLF1Q13351 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
KLF1Q13351 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
KLF1Q13351 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
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