Protein–RNA interactions for Protein: Q04900

CD164, Sialomucin core protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD164Q04900 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD164Q04900 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD164Q04900 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD164Q04900 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD164Q04900 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD164Q04900 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD164Q04900 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD164Q04900 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD164Q04900 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD164Q04900 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD164Q04900 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD164Q04900 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD164Q04900 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD164Q04900 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD164Q04900 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD164Q04900 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD164Q04900 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD164Q04900 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD164Q04900 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD164Q04900 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD164Q04900 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD164Q04900 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CD164Q04900 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD164Q04900 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD164Q04900 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD164Q04900 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD164Q04900 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD164Q04900 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD164Q04900 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD164Q04900 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD164Q04900 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD164Q04900 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD164Q04900 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD164Q04900 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD164Q04900 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD164Q04900 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD164Q04900 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD164Q04900 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD164Q04900 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD164Q04900 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD164Q04900 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD164Q04900 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD164Q04900 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD164Q04900 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD164Q04900 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD164Q04900 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD164Q04900 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD164Q04900 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD164Q04900 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD164Q04900 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD164Q04900 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD164Q04900 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD164Q04900 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD164Q04900 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD164Q04900 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD164Q04900 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD164Q04900 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CD164Q04900 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD164Q04900 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD164Q04900 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD164Q04900 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD164Q04900 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD164Q04900 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD164Q04900 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD164Q04900 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD164Q04900 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD164Q04900 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD164Q04900 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD164Q04900 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD164Q04900 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD164Q04900 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD164Q04900 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD164Q04900 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD164Q04900 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD164Q04900 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD164Q04900 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD164Q04900 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD164Q04900 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD164Q04900 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD164Q04900 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD164Q04900 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD164Q04900 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD164Q04900 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD164Q04900 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CD164Q04900 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD164Q04900 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD164Q04900 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD164Q04900 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD164Q04900 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD164Q04900 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD164Q04900 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD164Q04900 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD164Q04900 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD164Q04900 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD164Q04900 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD164Q04900 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD164Q04900 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD164Q04900 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD164Q04900 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD164Q04900 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms