Protein–RNA interactions for Protein: P81877

SSBP2, Single-stranded DNA-binding protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP2P81877 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSBP2P81877 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSBP2P81877 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SSBP2P81877 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SSBP2P81877 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SSBP2P81877 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SSBP2P81877 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SSBP2P81877 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SSBP2P81877 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SSBP2P81877 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SSBP2P81877 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SSBP2P81877 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SSBP2P81877 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SSBP2P81877 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SSBP2P81877 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSBP2P81877 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SSBP2P81877 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSBP2P81877 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSBP2P81877 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSBP2P81877 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSBP2P81877 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SSBP2P81877 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SSBP2P81877 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SSBP2P81877 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SSBP2P81877 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSBP2P81877 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSBP2P81877 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SSBP2P81877 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SSBP2P81877 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SSBP2P81877 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SSBP2P81877 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SSBP2P81877 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SSBP2P81877 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SSBP2P81877 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SSBP2P81877 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SSBP2P81877 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SSBP2P81877 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SSBP2P81877 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SSBP2P81877 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SSBP2P81877 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SSBP2P81877 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SSBP2P81877 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SSBP2P81877 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SSBP2P81877 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
SSBP2P81877 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SSBP2P81877 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SSBP2P81877 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SSBP2P81877 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SSBP2P81877 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SSBP2P81877 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SSBP2P81877 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SSBP2P81877 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SSBP2P81877 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SSBP2P81877 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SSBP2P81877 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SSBP2P81877 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SSBP2P81877 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SSBP2P81877 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SSBP2P81877 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SSBP2P81877 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SSBP2P81877 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SSBP2P81877 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SSBP2P81877 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SSBP2P81877 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SSBP2P81877 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SSBP2P81877 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SSBP2P81877 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SSBP2P81877 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SSBP2P81877 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SSBP2P81877 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SSBP2P81877 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SSBP2P81877 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SSBP2P81877 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SSBP2P81877 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SSBP2P81877 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SSBP2P81877 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SSBP2P81877 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SSBP2P81877 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SSBP2P81877 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SSBP2P81877 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SSBP2P81877 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SSBP2P81877 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SSBP2P81877 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SSBP2P81877 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SSBP2P81877 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SSBP2P81877 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SSBP2P81877 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SSBP2P81877 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SSBP2P81877 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SSBP2P81877 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SSBP2P81877 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SSBP2P81877 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SSBP2P81877 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SSBP2P81877 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SSBP2P81877 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SSBP2P81877 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SSBP2P81877 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SSBP2P81877 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SSBP2P81877 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SSBP2P81877 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.5 ms