Protein–RNA interactions for Protein: P57103

SLC8A3, Sodium/calcium exchanger 3, humanhuman

Predictions only

Length 927 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC8A3P57103 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SLC8A3P57103 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SLC8A3P57103 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SLC8A3P57103 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SLC8A3P57103 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SLC8A3P57103 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SLC8A3P57103 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SLC8A3P57103 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SLC8A3P57103 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SLC8A3P57103 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SLC8A3P57103 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SLC8A3P57103 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SLC8A3P57103 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SLC8A3P57103 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SLC8A3P57103 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
SLC8A3P57103 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SLC8A3P57103 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SLC8A3P57103 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SLC8A3P57103 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SLC8A3P57103 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SLC8A3P57103 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SLC8A3P57103 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SLC8A3P57103 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SLC8A3P57103 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SLC8A3P57103 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SLC8A3P57103 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SLC8A3P57103 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SLC8A3P57103 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SLC8A3P57103 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SLC8A3P57103 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SLC8A3P57103 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SLC8A3P57103 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SLC8A3P57103 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SLC8A3P57103 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SLC8A3P57103 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SLC8A3P57103 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SLC8A3P57103 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SLC8A3P57103 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SLC8A3P57103 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SLC8A3P57103 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SLC8A3P57103 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SLC8A3P57103 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SLC8A3P57103 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SLC8A3P57103 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SLC8A3P57103 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
SLC8A3P57103 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SLC8A3P57103 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SLC8A3P57103 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SLC8A3P57103 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SLC8A3P57103 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SLC8A3P57103 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SLC8A3P57103 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SLC8A3P57103 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SLC8A3P57103 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SLC8A3P57103 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SLC8A3P57103 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SLC8A3P57103 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SLC8A3P57103 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SLC8A3P57103 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SLC8A3P57103 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SLC8A3P57103 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SLC8A3P57103 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SLC8A3P57103 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SLC8A3P57103 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SLC8A3P57103 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SLC8A3P57103 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SLC8A3P57103 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
SLC8A3P57103 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SLC8A3P57103 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SLC8A3P57103 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
SLC8A3P57103 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SLC8A3P57103 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SLC8A3P57103 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SLC8A3P57103 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SLC8A3P57103 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SLC8A3P57103 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SLC8A3P57103 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SLC8A3P57103 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SLC8A3P57103 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SLC8A3P57103 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SLC8A3P57103 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SLC8A3P57103 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SLC8A3P57103 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SLC8A3P57103 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SLC8A3P57103 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SLC8A3P57103 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SLC8A3P57103 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
SLC8A3P57103 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SLC8A3P57103 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SLC8A3P57103 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SLC8A3P57103 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SLC8A3P57103 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SLC8A3P57103 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SLC8A3P57103 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SLC8A3P57103 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SLC8A3P57103 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SLC8A3P57103 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SLC8A3P57103 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SLC8A3P57103 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SLC8A3P57103 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms