Protein–RNA interactions for Protein: P40199

CEACAM6, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM6P40199 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CEACAM6P40199 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CEACAM6P40199 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CEACAM6P40199 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CEACAM6P40199 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CEACAM6P40199 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CEACAM6P40199 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CEACAM6P40199 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CEACAM6P40199 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CEACAM6P40199 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CEACAM6P40199 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CEACAM6P40199 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CEACAM6P40199 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CEACAM6P40199 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CEACAM6P40199 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CEACAM6P40199 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CEACAM6P40199 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CEACAM6P40199 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CEACAM6P40199 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CEACAM6P40199 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CEACAM6P40199 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CEACAM6P40199 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CEACAM6P40199 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CEACAM6P40199 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CEACAM6P40199 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CEACAM6P40199 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CEACAM6P40199 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CEACAM6P40199 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CEACAM6P40199 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CEACAM6P40199 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CEACAM6P40199 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CEACAM6P40199 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CEACAM6P40199 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CEACAM6P40199 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CEACAM6P40199 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CEACAM6P40199 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CEACAM6P40199 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CEACAM6P40199 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CEACAM6P40199 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CEACAM6P40199 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CEACAM6P40199 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CEACAM6P40199 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CEACAM6P40199 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CEACAM6P40199 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CEACAM6P40199 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CEACAM6P40199 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CEACAM6P40199 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CEACAM6P40199 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CEACAM6P40199 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CEACAM6P40199 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CEACAM6P40199 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CEACAM6P40199 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CEACAM6P40199 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CEACAM6P40199 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CEACAM6P40199 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CEACAM6P40199 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CEACAM6P40199 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CEACAM6P40199 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CEACAM6P40199 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CEACAM6P40199 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CEACAM6P40199 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CEACAM6P40199 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CEACAM6P40199 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CEACAM6P40199 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CEACAM6P40199 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CEACAM6P40199 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CEACAM6P40199 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CEACAM6P40199 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CEACAM6P40199 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CEACAM6P40199 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CEACAM6P40199 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CEACAM6P40199 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CEACAM6P40199 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CEACAM6P40199 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CEACAM6P40199 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CEACAM6P40199 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CEACAM6P40199 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CEACAM6P40199 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CEACAM6P40199 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CEACAM6P40199 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CEACAM6P40199 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CEACAM6P40199 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CEACAM6P40199 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CEACAM6P40199 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CEACAM6P40199 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CEACAM6P40199 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CEACAM6P40199 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CEACAM6P40199 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CEACAM6P40199 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CEACAM6P40199 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CEACAM6P40199 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CEACAM6P40199 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CEACAM6P40199 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CEACAM6P40199 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CEACAM6P40199 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CEACAM6P40199 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CEACAM6P40199 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CEACAM6P40199 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CEACAM6P40199 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CEACAM6P40199 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 660.2 ms