Protein–RNA interactions for Protein: P36955

SERPINF1, Pigment epithelium-derived factor, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINF1P36955 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SERPINF1P36955 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SERPINF1P36955 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SERPINF1P36955 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SERPINF1P36955 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SERPINF1P36955 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SERPINF1P36955 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SERPINF1P36955 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SERPINF1P36955 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SERPINF1P36955 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SERPINF1P36955 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SERPINF1P36955 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SERPINF1P36955 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SERPINF1P36955 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SERPINF1P36955 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SERPINF1P36955 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SERPINF1P36955 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SERPINF1P36955 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SERPINF1P36955 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SERPINF1P36955 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SERPINF1P36955 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SERPINF1P36955 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SERPINF1P36955 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SERPINF1P36955 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SERPINF1P36955 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SERPINF1P36955 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SERPINF1P36955 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SERPINF1P36955 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SERPINF1P36955 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SERPINF1P36955 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SERPINF1P36955 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SERPINF1P36955 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SERPINF1P36955 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SERPINF1P36955 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SERPINF1P36955 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SERPINF1P36955 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SERPINF1P36955 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SERPINF1P36955 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SERPINF1P36955 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SERPINF1P36955 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SERPINF1P36955 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SERPINF1P36955 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SERPINF1P36955 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SERPINF1P36955 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SERPINF1P36955 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SERPINF1P36955 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SERPINF1P36955 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SERPINF1P36955 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SERPINF1P36955 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SERPINF1P36955 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SERPINF1P36955 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SERPINF1P36955 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SERPINF1P36955 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SERPINF1P36955 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SERPINF1P36955 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SERPINF1P36955 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SERPINF1P36955 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SERPINF1P36955 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SERPINF1P36955 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SERPINF1P36955 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SERPINF1P36955 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SERPINF1P36955 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SERPINF1P36955 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SERPINF1P36955 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SERPINF1P36955 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SERPINF1P36955 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SERPINF1P36955 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SERPINF1P36955 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SERPINF1P36955 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SERPINF1P36955 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SERPINF1P36955 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SERPINF1P36955 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SERPINF1P36955 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SERPINF1P36955 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SERPINF1P36955 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SERPINF1P36955 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SERPINF1P36955 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SERPINF1P36955 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SERPINF1P36955 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SERPINF1P36955 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SERPINF1P36955 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SERPINF1P36955 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SERPINF1P36955 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SERPINF1P36955 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SERPINF1P36955 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SERPINF1P36955 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SERPINF1P36955 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SERPINF1P36955 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SERPINF1P36955 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SERPINF1P36955 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SERPINF1P36955 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SERPINF1P36955 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SERPINF1P36955 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SERPINF1P36955 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SERPINF1P36955 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SERPINF1P36955 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SERPINF1P36955 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SERPINF1P36955 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SERPINF1P36955 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SERPINF1P36955 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms