Protein–RNA interactions for Protein: P35716

SOX11, Transcription factor SOX-11, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX11P35716 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SOX11P35716 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SOX11P35716 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SOX11P35716 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SOX11P35716 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SOX11P35716 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SOX11P35716 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SOX11P35716 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SOX11P35716 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SOX11P35716 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SOX11P35716 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SOX11P35716 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SOX11P35716 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SOX11P35716 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SOX11P35716 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SOX11P35716 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SOX11P35716 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SOX11P35716 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SOX11P35716 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SOX11P35716 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SOX11P35716 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SOX11P35716 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SOX11P35716 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SOX11P35716 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SOX11P35716 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SOX11P35716 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SOX11P35716 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SOX11P35716 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SOX11P35716 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SOX11P35716 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SOX11P35716 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SOX11P35716 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SOX11P35716 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SOX11P35716 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SOX11P35716 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SOX11P35716 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SOX11P35716 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SOX11P35716 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SOX11P35716 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SOX11P35716 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SOX11P35716 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SOX11P35716 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SOX11P35716 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SOX11P35716 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SOX11P35716 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SOX11P35716 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SOX11P35716 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SOX11P35716 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SOX11P35716 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SOX11P35716 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SOX11P35716 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SOX11P35716 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SOX11P35716 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SOX11P35716 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SOX11P35716 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SOX11P35716 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SOX11P35716 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SOX11P35716 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SOX11P35716 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SOX11P35716 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SOX11P35716 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SOX11P35716 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SOX11P35716 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SOX11P35716 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SOX11P35716 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SOX11P35716 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SOX11P35716 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
SOX11P35716 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SOX11P35716 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SOX11P35716 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SOX11P35716 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SOX11P35716 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SOX11P35716 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SOX11P35716 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SOX11P35716 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SOX11P35716 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SOX11P35716 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SOX11P35716 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SOX11P35716 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SOX11P35716 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SOX11P35716 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SOX11P35716 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SOX11P35716 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SOX11P35716 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SOX11P35716 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SOX11P35716 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SOX11P35716 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SOX11P35716 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SOX11P35716 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SOX11P35716 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SOX11P35716 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SOX11P35716 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SOX11P35716 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SOX11P35716 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SOX11P35716 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SOX11P35716 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SOX11P35716 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SOX11P35716 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SOX11P35716 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SOX11P35716 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms