Protein–RNA interactions for Protein: P24864

CCNE1, G1/S-specific cyclin-E1, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNE1P24864 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
CCNE1P24864 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
CCNE1P24864 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
CCNE1P24864 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
CCNE1P24864 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.52
CCNE1P24864 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
CCNE1P24864 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
CCNE1P24864 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC30.74■■■□□ 2.51
CCNE1P24864 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
CCNE1P24864 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
CCNE1P24864 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
CCNE1P24864 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
CCNE1P24864 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
CCNE1P24864 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC30.73■■■□□ 2.51
CCNE1P24864 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
CCNE1P24864 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
CCNE1P24864 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
CCNE1P24864 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.72■■■□□ 2.51
CCNE1P24864 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
CCNE1P24864 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
CCNE1P24864 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
CCNE1P24864 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
CCNE1P24864 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
CCNE1P24864 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC30.7■■■□□ 2.51
CCNE1P24864 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
CCNE1P24864 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC30.69■■■□□ 2.5
CCNE1P24864 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
CCNE1P24864 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC30.66■■■□□ 2.5
CCNE1P24864 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
CCNE1P24864 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
CCNE1P24864 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
CCNE1P24864 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
CCNE1P24864 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
CCNE1P24864 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
CCNE1P24864 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
CCNE1P24864 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
CCNE1P24864 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
CCNE1P24864 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
CCNE1P24864 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC30.58■■■□□ 2.49
CCNE1P24864 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CCNE1P24864 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
CCNE1P24864 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
CCNE1P24864 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CCNE1P24864 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
CCNE1P24864 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CCNE1P24864 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CCNE1P24864 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
CCNE1P24864 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CCNE1P24864 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
CCNE1P24864 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
CCNE1P24864 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CCNE1P24864 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
CCNE1P24864 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CCNE1P24864 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CCNE1P24864 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CCNE1P24864 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CCNE1P24864 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CCNE1P24864 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
CCNE1P24864 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
CCNE1P24864 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
CCNE1P24864 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CCNE1P24864 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
CCNE1P24864 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
CCNE1P24864 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CCNE1P24864 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CCNE1P24864 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
CCNE1P24864 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
CCNE1P24864 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CCNE1P24864 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
CCNE1P24864 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
CCNE1P24864 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
CCNE1P24864 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
CCNE1P24864 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CCNE1P24864 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC30.27■■■□□ 2.44
CCNE1P24864 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
CCNE1P24864 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
CCNE1P24864 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC30.25■■■□□ 2.43
CCNE1P24864 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CCNE1P24864 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
CCNE1P24864 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
CCNE1P24864 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CCNE1P24864 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CCNE1P24864 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CCNE1P24864 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CCNE1P24864 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CCNE1P24864 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
CCNE1P24864 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CCNE1P24864 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CCNE1P24864 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CCNE1P24864 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CCNE1P24864 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CCNE1P24864 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CCNE1P24864 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CCNE1P24864 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC30.14■■■□□ 2.42
CCNE1P24864 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CCNE1P24864 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CCNE1P24864 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CCNE1P24864 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CCNE1P24864 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CCNE1P24864 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 6.8 ms