Protein–RNA interactions for Protein: P24386

CHM, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP24386 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CHMP24386 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CHMP24386 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHMP24386 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHMP24386 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CHMP24386 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHMP24386 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHMP24386 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHMP24386 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHMP24386 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHMP24386 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CHMP24386 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CHMP24386 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CHMP24386 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CHMP24386 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHMP24386 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHMP24386 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHMP24386 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHMP24386 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHMP24386 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHMP24386 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHMP24386 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHMP24386 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHMP24386 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHMP24386 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHMP24386 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHMP24386 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHMP24386 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHMP24386 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHMP24386 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHMP24386 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHMP24386 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHMP24386 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHMP24386 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHMP24386 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CHMP24386 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHMP24386 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHMP24386 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHMP24386 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHMP24386 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHMP24386 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHMP24386 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHMP24386 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHMP24386 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHMP24386 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHMP24386 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHMP24386 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHMP24386 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHMP24386 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHMP24386 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CHMP24386 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CHMP24386 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHMP24386 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHMP24386 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHMP24386 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CHMP24386 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CHMP24386 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHMP24386 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHMP24386 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHMP24386 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHMP24386 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHMP24386 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CHMP24386 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHMP24386 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHMP24386 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHMP24386 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHMP24386 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHMP24386 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHMP24386 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHMP24386 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHMP24386 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHMP24386 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHMP24386 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHMP24386 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHMP24386 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHMP24386 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CHMP24386 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHMP24386 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHMP24386 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHMP24386 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHMP24386 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHMP24386 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHMP24386 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHMP24386 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHMP24386 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHMP24386 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHMP24386 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHMP24386 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CHMP24386 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHMP24386 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHMP24386 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHMP24386 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHMP24386 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHMP24386 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHMP24386 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHMP24386 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHMP24386 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHMP24386 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHMP24386 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHMP24386 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms