Protein–RNA interactions for Protein: P20472

PVALB, Parvalbumin alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PVALBP20472 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PVALBP20472 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PVALBP20472 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PVALBP20472 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PVALBP20472 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PVALBP20472 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PVALBP20472 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PVALBP20472 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PVALBP20472 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PVALBP20472 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PVALBP20472 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PVALBP20472 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PVALBP20472 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PVALBP20472 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PVALBP20472 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PVALBP20472 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PVALBP20472 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PVALBP20472 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PVALBP20472 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PVALBP20472 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PVALBP20472 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PVALBP20472 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PVALBP20472 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PVALBP20472 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PVALBP20472 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PVALBP20472 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PVALBP20472 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PVALBP20472 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PVALBP20472 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PVALBP20472 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PVALBP20472 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PVALBP20472 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PVALBP20472 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PVALBP20472 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PVALBP20472 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PVALBP20472 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PVALBP20472 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PVALBP20472 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PVALBP20472 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PVALBP20472 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PVALBP20472 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PVALBP20472 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PVALBP20472 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PVALBP20472 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PVALBP20472 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PVALBP20472 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PVALBP20472 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PVALBP20472 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PVALBP20472 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PVALBP20472 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PVALBP20472 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PVALBP20472 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PVALBP20472 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PVALBP20472 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PVALBP20472 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PVALBP20472 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PVALBP20472 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PVALBP20472 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PVALBP20472 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PVALBP20472 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PVALBP20472 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PVALBP20472 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PVALBP20472 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PVALBP20472 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PVALBP20472 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PVALBP20472 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PVALBP20472 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PVALBP20472 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PVALBP20472 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PVALBP20472 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PVALBP20472 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PVALBP20472 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PVALBP20472 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PVALBP20472 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PVALBP20472 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PVALBP20472 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PVALBP20472 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PVALBP20472 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PVALBP20472 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PVALBP20472 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PVALBP20472 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PVALBP20472 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PVALBP20472 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PVALBP20472 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PVALBP20472 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PVALBP20472 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PVALBP20472 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PVALBP20472 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PVALBP20472 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PVALBP20472 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PVALBP20472 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PVALBP20472 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PVALBP20472 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PVALBP20472 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PVALBP20472 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PVALBP20472 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PVALBP20472 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PVALBP20472 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PVALBP20472 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PVALBP20472 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms