Protein–RNA interactions for Protein: P17174

GOT1, Aspartate aminotransferase, cytoplasmic, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOT1P17174 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
GOT1P17174 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
GOT1P17174 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
GOT1P17174 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
GOT1P17174 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
GOT1P17174 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
GOT1P17174 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
GOT1P17174 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
GOT1P17174 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
GOT1P17174 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
GOT1P17174 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
GOT1P17174 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
GOT1P17174 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
GOT1P17174 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
GOT1P17174 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
GOT1P17174 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
GOT1P17174 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
GOT1P17174 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
GOT1P17174 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
GOT1P17174 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
GOT1P17174 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
GOT1P17174 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
GOT1P17174 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
GOT1P17174 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
GOT1P17174 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.19
GOT1P17174 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
GOT1P17174 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
GOT1P17174 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
GOT1P17174 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
GOT1P17174 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
GOT1P17174 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
GOT1P17174 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
GOT1P17174 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GOT1P17174 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
GOT1P17174 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
GOT1P17174 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
GOT1P17174 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
GOT1P17174 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
GOT1P17174 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
GOT1P17174 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
GOT1P17174 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
GOT1P17174 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
GOT1P17174 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
GOT1P17174 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
GOT1P17174 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
GOT1P17174 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
GOT1P17174 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
GOT1P17174 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
GOT1P17174 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
GOT1P17174 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GOT1P17174 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
GOT1P17174 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
GOT1P17174 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
GOT1P17174 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
GOT1P17174 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.51■■■□□ 2.15
GOT1P17174 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
GOT1P17174 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
GOT1P17174 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
GOT1P17174 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
GOT1P17174 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GOT1P17174 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GOT1P17174 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
GOT1P17174 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GOT1P17174 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
GOT1P17174 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
GOT1P17174 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
GOT1P17174 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
GOT1P17174 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
GOT1P17174 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GOT1P17174 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
GOT1P17174 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
GOT1P17174 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GOT1P17174 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GOT1P17174 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GOT1P17174 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GOT1P17174 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GOT1P17174 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
GOT1P17174 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
GOT1P17174 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GOT1P17174 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GOT1P17174 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GOT1P17174 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
GOT1P17174 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
GOT1P17174 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
GOT1P17174 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
GOT1P17174 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GOT1P17174 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
GOT1P17174 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GOT1P17174 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GOT1P17174 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GOT1P17174 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
GOT1P17174 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
GOT1P17174 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
GOT1P17174 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
GOT1P17174 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GOT1P17174 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
GOT1P17174 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
GOT1P17174 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GOT1P17174 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GOT1P17174 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms