Protein–RNA interactions for Protein: P13631

RARG, Retinoic acid receptor gamma, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARGP13631 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
RARGP13631 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
RARGP13631 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
RARGP13631 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
RARGP13631 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
RARGP13631 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
RARGP13631 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
RARGP13631 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
RARGP13631 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
RARGP13631 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
RARGP13631 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
RARGP13631 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
RARGP13631 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
RARGP13631 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
RARGP13631 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
RARGP13631 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
RARGP13631 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
RARGP13631 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RARGP13631 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
RARGP13631 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
RARGP13631 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
RARGP13631 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
RARGP13631 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
RARGP13631 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
RARGP13631 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
RARGP13631 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
RARGP13631 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
RARGP13631 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RARGP13631 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RARGP13631 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RARGP13631 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RARGP13631 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RARGP13631 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC29.27■■■□□ 2.28
RARGP13631 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
RARGP13631 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
RARGP13631 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
RARGP13631 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
RARGP13631 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
RARGP13631 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.26
RARGP13631 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
RARGP13631 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
RARGP13631 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RARGP13631 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RARGP13631 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RARGP13631 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
RARGP13631 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RARGP13631 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
RARGP13631 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
RARGP13631 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
RARGP13631 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
RARGP13631 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RARGP13631 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RARGP13631 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
RARGP13631 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RARGP13631 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RARGP13631 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
RARGP13631 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
RARGP13631 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
RARGP13631 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RARGP13631 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RARGP13631 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
RARGP13631 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RARGP13631 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RARGP13631 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RARGP13631 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RARGP13631 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
RARGP13631 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RARGP13631 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RARGP13631 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RARGP13631 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RARGP13631 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RARGP13631 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RARGP13631 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RARGP13631 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RARGP13631 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RARGP13631 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RARGP13631 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RARGP13631 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RARGP13631 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RARGP13631 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RARGP13631 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.22
RARGP13631 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RARGP13631 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RARGP13631 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RARGP13631 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RARGP13631 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RARGP13631 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
RARGP13631 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RARGP13631 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RARGP13631 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RARGP13631 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RARGP13631 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RARGP13631 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RARGP13631 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RARGP13631 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RARGP13631 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RARGP13631 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RARGP13631 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RARGP13631 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RARGP13631 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms