Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
ITGA4P13612 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
ITGA4P13612 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
ITGA4P13612 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
ITGA4P13612 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
ITGA4P13612 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
ITGA4P13612 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
ITGA4P13612 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
ITGA4P13612 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.47
ITGA4P13612 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
ITGA4P13612 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
ITGA4P13612 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
ITGA4P13612 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC30.42■■■□□ 2.46
ITGA4P13612 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
ITGA4P13612 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
ITGA4P13612 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
ITGA4P13612 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
ITGA4P13612 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.41■■■□□ 2.46
ITGA4P13612 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
ITGA4P13612 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
ITGA4P13612 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
ITGA4P13612 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
ITGA4P13612 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
ITGA4P13612 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
ITGA4P13612 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
ITGA4P13612 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
ITGA4P13612 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
ITGA4P13612 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
ITGA4P13612 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
ITGA4P13612 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
ITGA4P13612 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
ITGA4P13612 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
ITGA4P13612 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
ITGA4P13612 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
ITGA4P13612 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
ITGA4P13612 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
ITGA4P13612 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
ITGA4P13612 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
ITGA4P13612 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
ITGA4P13612 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
ITGA4P13612 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
ITGA4P13612 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
ITGA4P13612 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
ITGA4P13612 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
ITGA4P13612 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
ITGA4P13612 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
ITGA4P13612 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
ITGA4P13612 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
ITGA4P13612 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
ITGA4P13612 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
ITGA4P13612 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
ITGA4P13612 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
ITGA4P13612 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
ITGA4P13612 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
ITGA4P13612 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
ITGA4P13612 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
ITGA4P13612 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
ITGA4P13612 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
ITGA4P13612 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
ITGA4P13612 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
ITGA4P13612 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
ITGA4P13612 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
ITGA4P13612 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
ITGA4P13612 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
ITGA4P13612 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ITGA4P13612 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
ITGA4P13612 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
ITGA4P13612 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
ITGA4P13612 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
ITGA4P13612 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
ITGA4P13612 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ITGA4P13612 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ITGA4P13612 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
ITGA4P13612 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
ITGA4P13612 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
ITGA4P13612 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
ITGA4P13612 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
ITGA4P13612 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
ITGA4P13612 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
ITGA4P13612 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
ITGA4P13612 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
ITGA4P13612 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
ITGA4P13612 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.95■■■□□ 2.38
ITGA4P13612 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
ITGA4P13612 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
ITGA4P13612 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
ITGA4P13612 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
ITGA4P13612 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
ITGA4P13612 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
ITGA4P13612 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
ITGA4P13612 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
ITGA4P13612 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ITGA4P13612 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ITGA4P13612 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
ITGA4P13612 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
ITGA4P13612 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
ITGA4P13612 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
ITGA4P13612 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
ITGA4P13612 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
ITGA4P13612 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms