Protein–RNA interactions for Protein: P01584

IL1B, Interleukin-1 beta, humanhuman

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL1BP01584 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
IL1BP01584 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
IL1BP01584 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
IL1BP01584 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
IL1BP01584 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
IL1BP01584 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
IL1BP01584 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
IL1BP01584 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
IL1BP01584 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
IL1BP01584 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
IL1BP01584 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.53■■■□□ 2.16
IL1BP01584 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
IL1BP01584 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
IL1BP01584 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
IL1BP01584 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
IL1BP01584 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
IL1BP01584 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
IL1BP01584 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
IL1BP01584 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
IL1BP01584 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
IL1BP01584 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
IL1BP01584 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
IL1BP01584 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
IL1BP01584 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
IL1BP01584 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
IL1BP01584 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
IL1BP01584 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
IL1BP01584 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
IL1BP01584 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
IL1BP01584 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
IL1BP01584 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
IL1BP01584 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
IL1BP01584 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
IL1BP01584 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
IL1BP01584 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
IL1BP01584 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
IL1BP01584 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
IL1BP01584 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
IL1BP01584 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
IL1BP01584 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
IL1BP01584 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
IL1BP01584 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
IL1BP01584 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
IL1BP01584 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
IL1BP01584 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
IL1BP01584 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
IL1BP01584 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
IL1BP01584 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
IL1BP01584 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
IL1BP01584 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
IL1BP01584 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
IL1BP01584 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
IL1BP01584 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
IL1BP01584 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
IL1BP01584 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
IL1BP01584 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
IL1BP01584 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
IL1BP01584 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
IL1BP01584 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
IL1BP01584 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
IL1BP01584 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
IL1BP01584 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
IL1BP01584 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
IL1BP01584 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
IL1BP01584 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
IL1BP01584 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
IL1BP01584 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
IL1BP01584 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
IL1BP01584 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
IL1BP01584 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
IL1BP01584 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
IL1BP01584 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
IL1BP01584 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
IL1BP01584 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
IL1BP01584 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
IL1BP01584 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
IL1BP01584 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
IL1BP01584 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
IL1BP01584 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
IL1BP01584 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
IL1BP01584 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
IL1BP01584 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
IL1BP01584 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
IL1BP01584 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
IL1BP01584 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
IL1BP01584 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
IL1BP01584 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
IL1BP01584 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
IL1BP01584 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
IL1BP01584 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
IL1BP01584 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
IL1BP01584 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
IL1BP01584 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
IL1BP01584 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
IL1BP01584 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
IL1BP01584 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
IL1BP01584 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
IL1BP01584 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
IL1BP01584 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
IL1BP01584 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms