Protein–RNA interactions for Protein: O95260

ATE1, Arginyl-tRNA--protein transferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATE1O95260 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATE1O95260 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATE1O95260 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATE1O95260 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
ATE1O95260 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATE1O95260 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATE1O95260 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATE1O95260 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATE1O95260 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATE1O95260 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATE1O95260 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATE1O95260 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ATE1O95260 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATE1O95260 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATE1O95260 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATE1O95260 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATE1O95260 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATE1O95260 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATE1O95260 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATE1O95260 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
ATE1O95260 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATE1O95260 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
ATE1O95260 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATE1O95260 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
ATE1O95260 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATE1O95260 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATE1O95260 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATE1O95260 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATE1O95260 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATE1O95260 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATE1O95260 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATE1O95260 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATE1O95260 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATE1O95260 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATE1O95260 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
ATE1O95260 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATE1O95260 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATE1O95260 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATE1O95260 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATE1O95260 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATE1O95260 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATE1O95260 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATE1O95260 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATE1O95260 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATE1O95260 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATE1O95260 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATE1O95260 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATE1O95260 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATE1O95260 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATE1O95260 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATE1O95260 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATE1O95260 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATE1O95260 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATE1O95260 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
ATE1O95260 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATE1O95260 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATE1O95260 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATE1O95260 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATE1O95260 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATE1O95260 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATE1O95260 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATE1O95260 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATE1O95260 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATE1O95260 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATE1O95260 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ATE1O95260 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATE1O95260 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATE1O95260 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATE1O95260 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATE1O95260 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATE1O95260 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATE1O95260 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATE1O95260 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATE1O95260 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATE1O95260 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATE1O95260 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATE1O95260 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATE1O95260 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATE1O95260 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATE1O95260 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATE1O95260 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATE1O95260 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATE1O95260 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATE1O95260 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
ATE1O95260 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATE1O95260 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATE1O95260 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATE1O95260 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATE1O95260 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATE1O95260 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATE1O95260 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATE1O95260 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATE1O95260 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATE1O95260 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATE1O95260 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATE1O95260 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATE1O95260 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATE1O95260 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATE1O95260 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATE1O95260 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms