Protein–RNA interactions for Protein: O43760

SYNGR2, Synaptogyrin-2, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR2O43760 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYNGR2O43760 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYNGR2O43760 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYNGR2O43760 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNGR2O43760 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNGR2O43760 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYNGR2O43760 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYNGR2O43760 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYNGR2O43760 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYNGR2O43760 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYNGR2O43760 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYNGR2O43760 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYNGR2O43760 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYNGR2O43760 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYNGR2O43760 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYNGR2O43760 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYNGR2O43760 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYNGR2O43760 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYNGR2O43760 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYNGR2O43760 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYNGR2O43760 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYNGR2O43760 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYNGR2O43760 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYNGR2O43760 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYNGR2O43760 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYNGR2O43760 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYNGR2O43760 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYNGR2O43760 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYNGR2O43760 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SYNGR2O43760 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYNGR2O43760 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYNGR2O43760 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYNGR2O43760 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYNGR2O43760 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYNGR2O43760 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SYNGR2O43760 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYNGR2O43760 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYNGR2O43760 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYNGR2O43760 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYNGR2O43760 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYNGR2O43760 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYNGR2O43760 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYNGR2O43760 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYNGR2O43760 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYNGR2O43760 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYNGR2O43760 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYNGR2O43760 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SYNGR2O43760 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYNGR2O43760 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYNGR2O43760 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYNGR2O43760 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYNGR2O43760 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYNGR2O43760 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYNGR2O43760 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYNGR2O43760 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYNGR2O43760 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYNGR2O43760 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYNGR2O43760 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYNGR2O43760 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYNGR2O43760 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYNGR2O43760 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SYNGR2O43760 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYNGR2O43760 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYNGR2O43760 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYNGR2O43760 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYNGR2O43760 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYNGR2O43760 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYNGR2O43760 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYNGR2O43760 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYNGR2O43760 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYNGR2O43760 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYNGR2O43760 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYNGR2O43760 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYNGR2O43760 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYNGR2O43760 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYNGR2O43760 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYNGR2O43760 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYNGR2O43760 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYNGR2O43760 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYNGR2O43760 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYNGR2O43760 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYNGR2O43760 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYNGR2O43760 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYNGR2O43760 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYNGR2O43760 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYNGR2O43760 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYNGR2O43760 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYNGR2O43760 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYNGR2O43760 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYNGR2O43760 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYNGR2O43760 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYNGR2O43760 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYNGR2O43760 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYNGR2O43760 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYNGR2O43760 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYNGR2O43760 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYNGR2O43760 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYNGR2O43760 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SYNGR2O43760 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SYNGR2O43760 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms