Protein–RNA interactions for Protein: O43760

SYNGR2, Synaptogyrin-2, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR2O43760 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SYNGR2O43760 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
SYNGR2O43760 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SYNGR2O43760 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SYNGR2O43760 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SYNGR2O43760 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SYNGR2O43760 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
SYNGR2O43760 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SYNGR2O43760 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SYNGR2O43760 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYNGR2O43760 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYNGR2O43760 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SYNGR2O43760 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SYNGR2O43760 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SYNGR2O43760 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SYNGR2O43760 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SYNGR2O43760 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SYNGR2O43760 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYNGR2O43760 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYNGR2O43760 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYNGR2O43760 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYNGR2O43760 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SYNGR2O43760 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYNGR2O43760 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYNGR2O43760 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SYNGR2O43760 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SYNGR2O43760 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SYNGR2O43760 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYNGR2O43760 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SYNGR2O43760 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYNGR2O43760 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYNGR2O43760 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYNGR2O43760 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SYNGR2O43760 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYNGR2O43760 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYNGR2O43760 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYNGR2O43760 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYNGR2O43760 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYNGR2O43760 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYNGR2O43760 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SYNGR2O43760 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYNGR2O43760 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYNGR2O43760 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SYNGR2O43760 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SYNGR2O43760 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYNGR2O43760 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYNGR2O43760 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYNGR2O43760 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYNGR2O43760 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYNGR2O43760 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYNGR2O43760 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SYNGR2O43760 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYNGR2O43760 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYNGR2O43760 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYNGR2O43760 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYNGR2O43760 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SYNGR2O43760 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYNGR2O43760 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYNGR2O43760 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYNGR2O43760 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SYNGR2O43760 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SYNGR2O43760 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYNGR2O43760 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYNGR2O43760 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYNGR2O43760 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SYNGR2O43760 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SYNGR2O43760 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SYNGR2O43760 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYNGR2O43760 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYNGR2O43760 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYNGR2O43760 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYNGR2O43760 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYNGR2O43760 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYNGR2O43760 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYNGR2O43760 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SYNGR2O43760 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SYNGR2O43760 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYNGR2O43760 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYNGR2O43760 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYNGR2O43760 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYNGR2O43760 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYNGR2O43760 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYNGR2O43760 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYNGR2O43760 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYNGR2O43760 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYNGR2O43760 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYNGR2O43760 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYNGR2O43760 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYNGR2O43760 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYNGR2O43760 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYNGR2O43760 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SYNGR2O43760 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYNGR2O43760 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYNGR2O43760 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYNGR2O43760 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYNGR2O43760 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYNGR2O43760 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYNGR2O43760 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYNGR2O43760 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYNGR2O43760 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms