Protein–RNA interactions for Protein: O14545

TRAFD1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAFD1O14545 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRAFD1O14545 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRAFD1O14545 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TRAFD1O14545 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TRAFD1O14545 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TRAFD1O14545 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRAFD1O14545 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRAFD1O14545 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRAFD1O14545 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TRAFD1O14545 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRAFD1O14545 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRAFD1O14545 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRAFD1O14545 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRAFD1O14545 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRAFD1O14545 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRAFD1O14545 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRAFD1O14545 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRAFD1O14545 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRAFD1O14545 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRAFD1O14545 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRAFD1O14545 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRAFD1O14545 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRAFD1O14545 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRAFD1O14545 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRAFD1O14545 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRAFD1O14545 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.12
TRAFD1O14545 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRAFD1O14545 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRAFD1O14545 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRAFD1O14545 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TRAFD1O14545 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TRAFD1O14545 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
TRAFD1O14545 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TRAFD1O14545 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRAFD1O14545 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRAFD1O14545 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRAFD1O14545 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRAFD1O14545 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRAFD1O14545 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TRAFD1O14545 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
TRAFD1O14545 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRAFD1O14545 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRAFD1O14545 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRAFD1O14545 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRAFD1O14545 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRAFD1O14545 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRAFD1O14545 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRAFD1O14545 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRAFD1O14545 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRAFD1O14545 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRAFD1O14545 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRAFD1O14545 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRAFD1O14545 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRAFD1O14545 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRAFD1O14545 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRAFD1O14545 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRAFD1O14545 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRAFD1O14545 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRAFD1O14545 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
TRAFD1O14545 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRAFD1O14545 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRAFD1O14545 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRAFD1O14545 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRAFD1O14545 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
TRAFD1O14545 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRAFD1O14545 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRAFD1O14545 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRAFD1O14545 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRAFD1O14545 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRAFD1O14545 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRAFD1O14545 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRAFD1O14545 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRAFD1O14545 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRAFD1O14545 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRAFD1O14545 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRAFD1O14545 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRAFD1O14545 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRAFD1O14545 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRAFD1O14545 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRAFD1O14545 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRAFD1O14545 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
TRAFD1O14545 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRAFD1O14545 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRAFD1O14545 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRAFD1O14545 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRAFD1O14545 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRAFD1O14545 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRAFD1O14545 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRAFD1O14545 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRAFD1O14545 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRAFD1O14545 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRAFD1O14545 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRAFD1O14545 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRAFD1O14545 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRAFD1O14545 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRAFD1O14545 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRAFD1O14545 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRAFD1O14545 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
TRAFD1O14545 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRAFD1O14545 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.6 ms