Protein–RNA interactions for Protein: O00762

UBE2C, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 C, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2CO00762 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBE2CO00762 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBE2CO00762 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBE2CO00762 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBE2CO00762 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBE2CO00762 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBE2CO00762 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBE2CO00762 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBE2CO00762 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBE2CO00762 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBE2CO00762 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBE2CO00762 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBE2CO00762 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBE2CO00762 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBE2CO00762 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBE2CO00762 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBE2CO00762 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBE2CO00762 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBE2CO00762 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
UBE2CO00762 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
UBE2CO00762 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBE2CO00762 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBE2CO00762 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBE2CO00762 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBE2CO00762 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
UBE2CO00762 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBE2CO00762 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBE2CO00762 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBE2CO00762 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBE2CO00762 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBE2CO00762 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBE2CO00762 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBE2CO00762 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBE2CO00762 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBE2CO00762 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBE2CO00762 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBE2CO00762 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBE2CO00762 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBE2CO00762 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBE2CO00762 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBE2CO00762 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBE2CO00762 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBE2CO00762 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBE2CO00762 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBE2CO00762 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBE2CO00762 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
UBE2CO00762 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
UBE2CO00762 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBE2CO00762 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBE2CO00762 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBE2CO00762 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBE2CO00762 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBE2CO00762 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBE2CO00762 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBE2CO00762 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBE2CO00762 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBE2CO00762 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBE2CO00762 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBE2CO00762 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBE2CO00762 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBE2CO00762 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBE2CO00762 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBE2CO00762 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBE2CO00762 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBE2CO00762 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBE2CO00762 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
UBE2CO00762 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
UBE2CO00762 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBE2CO00762 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBE2CO00762 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBE2CO00762 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBE2CO00762 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBE2CO00762 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBE2CO00762 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBE2CO00762 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBE2CO00762 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBE2CO00762 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBE2CO00762 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBE2CO00762 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
UBE2CO00762 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBE2CO00762 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBE2CO00762 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBE2CO00762 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBE2CO00762 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBE2CO00762 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBE2CO00762 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBE2CO00762 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBE2CO00762 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBE2CO00762 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBE2CO00762 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBE2CO00762 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBE2CO00762 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBE2CO00762 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBE2CO00762 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBE2CO00762 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBE2CO00762 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBE2CO00762 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBE2CO00762 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBE2CO00762 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBE2CO00762 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
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