Protein–RNA interactions for Protein: O00762

UBE2C, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 C, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2CO00762 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
UBE2CO00762 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
UBE2CO00762 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
UBE2CO00762 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
UBE2CO00762 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
UBE2CO00762 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
UBE2CO00762 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
UBE2CO00762 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
UBE2CO00762 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
UBE2CO00762 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
UBE2CO00762 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBE2CO00762 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
UBE2CO00762 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
UBE2CO00762 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
UBE2CO00762 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
UBE2CO00762 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBE2CO00762 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBE2CO00762 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBE2CO00762 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBE2CO00762 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBE2CO00762 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBE2CO00762 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBE2CO00762 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
UBE2CO00762 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBE2CO00762 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBE2CO00762 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBE2CO00762 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBE2CO00762 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBE2CO00762 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBE2CO00762 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBE2CO00762 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
UBE2CO00762 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBE2CO00762 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBE2CO00762 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBE2CO00762 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBE2CO00762 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBE2CO00762 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBE2CO00762 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBE2CO00762 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBE2CO00762 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBE2CO00762 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBE2CO00762 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBE2CO00762 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
UBE2CO00762 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
UBE2CO00762 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
UBE2CO00762 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBE2CO00762 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBE2CO00762 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
UBE2CO00762 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
UBE2CO00762 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
UBE2CO00762 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
UBE2CO00762 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBE2CO00762 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBE2CO00762 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBE2CO00762 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBE2CO00762 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
UBE2CO00762 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBE2CO00762 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBE2CO00762 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBE2CO00762 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBE2CO00762 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBE2CO00762 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBE2CO00762 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBE2CO00762 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBE2CO00762 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBE2CO00762 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBE2CO00762 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBE2CO00762 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBE2CO00762 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBE2CO00762 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBE2CO00762 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBE2CO00762 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBE2CO00762 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBE2CO00762 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBE2CO00762 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBE2CO00762 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBE2CO00762 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBE2CO00762 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBE2CO00762 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBE2CO00762 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBE2CO00762 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBE2CO00762 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBE2CO00762 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBE2CO00762 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
UBE2CO00762 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBE2CO00762 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBE2CO00762 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBE2CO00762 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBE2CO00762 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBE2CO00762 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBE2CO00762 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBE2CO00762 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBE2CO00762 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBE2CO00762 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBE2CO00762 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBE2CO00762 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBE2CO00762 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBE2CO00762 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBE2CO00762 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBE2CO00762 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
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