Protein–RNA interactions for Protein: A8MVJ9

Putative histone PARylation factor 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A8MVJ9 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
A8MVJ9 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
A8MVJ9 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
A8MVJ9 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
A8MVJ9 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
A8MVJ9 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
A8MVJ9 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
A8MVJ9 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
A8MVJ9 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
A8MVJ9 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
A8MVJ9 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
A8MVJ9 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
A8MVJ9 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
A8MVJ9 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
A8MVJ9 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
A8MVJ9 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
A8MVJ9 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
A8MVJ9 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
A8MVJ9 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
A8MVJ9 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
A8MVJ9 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
A8MVJ9 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
A8MVJ9 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
A8MVJ9 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
A8MVJ9 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
A8MVJ9 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
A8MVJ9 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
A8MVJ9 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
A8MVJ9 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
A8MVJ9 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
A8MVJ9 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
A8MVJ9 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
A8MVJ9 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
A8MVJ9 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
A8MVJ9 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
A8MVJ9 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
A8MVJ9 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
A8MVJ9 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
A8MVJ9 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
A8MVJ9 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
A8MVJ9 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
A8MVJ9 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
A8MVJ9 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
A8MVJ9 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
A8MVJ9 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
A8MVJ9 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
A8MVJ9 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
A8MVJ9 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
A8MVJ9 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
A8MVJ9 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
A8MVJ9 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
A8MVJ9 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
A8MVJ9 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
A8MVJ9 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
A8MVJ9 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
A8MVJ9 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
A8MVJ9 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
A8MVJ9 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
A8MVJ9 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
A8MVJ9 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
A8MVJ9 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
A8MVJ9 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
A8MVJ9 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
A8MVJ9 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
A8MVJ9 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
A8MVJ9 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
A8MVJ9 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
A8MVJ9 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
A8MVJ9 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
A8MVJ9 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
A8MVJ9 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
A8MVJ9 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
A8MVJ9 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
A8MVJ9 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
A8MVJ9 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
A8MVJ9 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
A8MVJ9 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
A8MVJ9 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
A8MVJ9 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
A8MVJ9 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
A8MVJ9 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
A8MVJ9 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
A8MVJ9 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
A8MVJ9 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
A8MVJ9 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
A8MVJ9 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
A8MVJ9 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
A8MVJ9 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
A8MVJ9 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
A8MVJ9 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
A8MVJ9 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
A8MVJ9 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
A8MVJ9 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
A8MVJ9 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
A8MVJ9 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
A8MVJ9 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
A8MVJ9 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
A8MVJ9 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
A8MVJ9 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
A8MVJ9 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms