Protein–RNA interactions for Protein: A8MVJ9

Putative histone PARylation factor 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A8MVJ9 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC31.61■■■□□ 2.65
A8MVJ9 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
A8MVJ9 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
A8MVJ9 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
A8MVJ9 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
A8MVJ9 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC30.66■■■□□ 2.5
A8MVJ9 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
A8MVJ9 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
A8MVJ9 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
A8MVJ9 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC30.44■■■□□ 2.46
A8MVJ9 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
A8MVJ9 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
A8MVJ9 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
A8MVJ9 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
A8MVJ9 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
A8MVJ9 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
A8MVJ9 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
A8MVJ9 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
A8MVJ9 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
A8MVJ9 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
A8MVJ9 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
A8MVJ9 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
A8MVJ9 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
A8MVJ9 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
A8MVJ9 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
A8MVJ9 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
A8MVJ9 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
A8MVJ9 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
A8MVJ9 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
A8MVJ9 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
A8MVJ9 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
A8MVJ9 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
A8MVJ9 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
A8MVJ9 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
A8MVJ9 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
A8MVJ9 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
A8MVJ9 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
A8MVJ9 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
A8MVJ9 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
A8MVJ9 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
A8MVJ9 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
A8MVJ9 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
A8MVJ9 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
A8MVJ9 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
A8MVJ9 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
A8MVJ9 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
A8MVJ9 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
A8MVJ9 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
A8MVJ9 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
A8MVJ9 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
A8MVJ9 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
A8MVJ9 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
A8MVJ9 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
A8MVJ9 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
A8MVJ9 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
A8MVJ9 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
A8MVJ9 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
A8MVJ9 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
A8MVJ9 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
A8MVJ9 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
A8MVJ9 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
A8MVJ9 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
A8MVJ9 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
A8MVJ9 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
A8MVJ9 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
A8MVJ9 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
A8MVJ9 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
A8MVJ9 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
A8MVJ9 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
A8MVJ9 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
A8MVJ9 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
A8MVJ9 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
A8MVJ9 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
A8MVJ9 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
A8MVJ9 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
A8MVJ9 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
A8MVJ9 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
A8MVJ9 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
A8MVJ9 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
A8MVJ9 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
A8MVJ9 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
A8MVJ9 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
A8MVJ9 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
A8MVJ9 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
A8MVJ9 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
A8MVJ9 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
A8MVJ9 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
A8MVJ9 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
A8MVJ9 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
A8MVJ9 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
A8MVJ9 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
A8MVJ9 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
A8MVJ9 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
A8MVJ9 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
A8MVJ9 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
A8MVJ9 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
A8MVJ9 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
A8MVJ9 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
A8MVJ9 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
A8MVJ9 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms