Protein–RNA interactions for Protein: A2RUB1

MEIOC, Meiosis-specific coiled-coil domain-containing protein MEIOC, humanhuman

Predictions only

Length 952 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIOCA2RUB1 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MEIOCA2RUB1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MEIOCA2RUB1 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MEIOCA2RUB1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
MEIOCA2RUB1 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MEIOCA2RUB1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MEIOCA2RUB1 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
MEIOCA2RUB1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
MEIOCA2RUB1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
MEIOCA2RUB1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MEIOCA2RUB1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MEIOCA2RUB1 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MEIOCA2RUB1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MEIOCA2RUB1 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MEIOCA2RUB1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MEIOCA2RUB1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MEIOCA2RUB1 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MEIOCA2RUB1 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MEIOCA2RUB1 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
MEIOCA2RUB1 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MEIOCA2RUB1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MEIOCA2RUB1 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MEIOCA2RUB1 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MEIOCA2RUB1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MEIOCA2RUB1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MEIOCA2RUB1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MEIOCA2RUB1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MEIOCA2RUB1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MEIOCA2RUB1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MEIOCA2RUB1 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MEIOCA2RUB1 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MEIOCA2RUB1 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MEIOCA2RUB1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MEIOCA2RUB1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MEIOCA2RUB1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MEIOCA2RUB1 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MEIOCA2RUB1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MEIOCA2RUB1 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MEIOCA2RUB1 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MEIOCA2RUB1 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MEIOCA2RUB1 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MEIOCA2RUB1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MEIOCA2RUB1 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MEIOCA2RUB1 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MEIOCA2RUB1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MEIOCA2RUB1 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MEIOCA2RUB1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MEIOCA2RUB1 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MEIOCA2RUB1 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MEIOCA2RUB1 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MEIOCA2RUB1 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
MEIOCA2RUB1 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MEIOCA2RUB1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MEIOCA2RUB1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MEIOCA2RUB1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MEIOCA2RUB1 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MEIOCA2RUB1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MEIOCA2RUB1 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MEIOCA2RUB1 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MEIOCA2RUB1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MEIOCA2RUB1 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MEIOCA2RUB1 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MEIOCA2RUB1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MEIOCA2RUB1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MEIOCA2RUB1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MEIOCA2RUB1 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MEIOCA2RUB1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MEIOCA2RUB1 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MEIOCA2RUB1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MEIOCA2RUB1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MEIOCA2RUB1 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MEIOCA2RUB1 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MEIOCA2RUB1 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MEIOCA2RUB1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MEIOCA2RUB1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MEIOCA2RUB1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MEIOCA2RUB1 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MEIOCA2RUB1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MEIOCA2RUB1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MEIOCA2RUB1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MEIOCA2RUB1 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MEIOCA2RUB1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MEIOCA2RUB1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MEIOCA2RUB1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MEIOCA2RUB1 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MEIOCA2RUB1 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MEIOCA2RUB1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MEIOCA2RUB1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MEIOCA2RUB1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MEIOCA2RUB1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MEIOCA2RUB1 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MEIOCA2RUB1 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MEIOCA2RUB1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MEIOCA2RUB1 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MEIOCA2RUB1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MEIOCA2RUB1 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MEIOCA2RUB1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MEIOCA2RUB1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MEIOCA2RUB1 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MEIOCA2RUB1 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms