Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YVX5

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0J9YVX5 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
A0A0J9YVX5 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
A0A0J9YVX5 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
A0A0J9YVX5 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
A0A0J9YVX5 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
A0A0J9YVX5 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
A0A0J9YVX5 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
A0A0J9YVX5 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
A0A0J9YVX5 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
A0A0J9YVX5 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
A0A0J9YVX5 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
A0A0J9YVX5 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
A0A0J9YVX5 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
A0A0J9YVX5 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
A0A0J9YVX5 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
A0A0J9YVX5 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
A0A0J9YVX5 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
A0A0J9YVX5 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
A0A0J9YVX5 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
A0A0J9YVX5 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
A0A0J9YVX5 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
A0A0J9YVX5 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
A0A0J9YVX5 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
A0A0J9YVX5 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
A0A0J9YVX5 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
A0A0J9YVX5 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
A0A0J9YVX5 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
A0A0J9YVX5 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
A0A0J9YVX5 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
A0A0J9YVX5 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
A0A0J9YVX5 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
A0A0J9YVX5 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
A0A0J9YVX5 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
A0A0J9YVX5 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
A0A0J9YVX5 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
A0A0J9YVX5 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
A0A0J9YVX5 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
A0A0J9YVX5 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
A0A0J9YVX5 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
A0A0J9YVX5 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
A0A0J9YVX5 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
A0A0J9YVX5 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
A0A0J9YVX5 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
A0A0J9YVX5 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
A0A0J9YVX5 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
A0A0J9YVX5 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
A0A0J9YVX5 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
A0A0J9YVX5 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
A0A0J9YVX5 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
A0A0J9YVX5 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
A0A0J9YVX5 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
A0A0J9YVX5 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
A0A0J9YVX5 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
A0A0J9YVX5 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
A0A0J9YVX5 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
A0A0J9YVX5 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
A0A0J9YVX5 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
A0A0J9YVX5 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
A0A0J9YVX5 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
A0A0J9YVX5 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
A0A0J9YVX5 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
A0A0J9YVX5 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
A0A0J9YVX5 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
A0A0J9YVX5 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
A0A0J9YVX5 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
A0A0J9YVX5 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
A0A0J9YVX5 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
A0A0J9YVX5 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
A0A0J9YVX5 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
A0A0J9YVX5 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
A0A0J9YVX5 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
A0A0J9YVX5 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
A0A0J9YVX5 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
A0A0J9YVX5 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
A0A0J9YVX5 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
A0A0J9YVX5 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
A0A0J9YVX5 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
A0A0J9YVX5 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
A0A0J9YVX5 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
A0A0J9YVX5 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
A0A0J9YVX5 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
A0A0J9YVX5 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
A0A0J9YVX5 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
A0A0J9YVX5 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
A0A0J9YVX5 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
A0A0J9YVX5 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
A0A0J9YVX5 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
A0A0J9YVX5 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
A0A0J9YVX5 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
A0A0J9YVX5 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
A0A0J9YVX5 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
A0A0J9YVX5 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
A0A0J9YVX5 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
A0A0J9YVX5 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
A0A0J9YVX5 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
A0A0J9YVX5 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
A0A0J9YVX5 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
A0A0J9YVX5 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
A0A0J9YVX5 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
A0A0J9YVX5 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms