Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1Y9

IGHV3-72, Immunoglobulin heavy variable 3-72, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms