Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6B7

AP4B1, AP-4 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP4B1Q9Y6B7 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
AP4B1Q9Y6B7 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
AP4B1Q9Y6B7 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
AP4B1Q9Y6B7 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
AP4B1Q9Y6B7 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
AP4B1Q9Y6B7 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
AP4B1Q9Y6B7 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
AP4B1Q9Y6B7 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
AP4B1Q9Y6B7 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
AP4B1Q9Y6B7 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
AP4B1Q9Y6B7 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
AP4B1Q9Y6B7 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
AP4B1Q9Y6B7 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
AP4B1Q9Y6B7 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
AP4B1Q9Y6B7 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
AP4B1Q9Y6B7 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
AP4B1Q9Y6B7 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
AP4B1Q9Y6B7 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
AP4B1Q9Y6B7 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
AP4B1Q9Y6B7 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
AP4B1Q9Y6B7 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
AP4B1Q9Y6B7 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
AP4B1Q9Y6B7 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
AP4B1Q9Y6B7 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
AP4B1Q9Y6B7 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
AP4B1Q9Y6B7 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
AP4B1Q9Y6B7 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
AP4B1Q9Y6B7 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
AP4B1Q9Y6B7 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
AP4B1Q9Y6B7 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
AP4B1Q9Y6B7 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
AP4B1Q9Y6B7 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
AP4B1Q9Y6B7 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
AP4B1Q9Y6B7 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
AP4B1Q9Y6B7 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
AP4B1Q9Y6B7 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
AP4B1Q9Y6B7 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
AP4B1Q9Y6B7 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
AP4B1Q9Y6B7 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
AP4B1Q9Y6B7 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
AP4B1Q9Y6B7 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
AP4B1Q9Y6B7 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
AP4B1Q9Y6B7 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
AP4B1Q9Y6B7 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
AP4B1Q9Y6B7 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
AP4B1Q9Y6B7 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
AP4B1Q9Y6B7 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
AP4B1Q9Y6B7 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
AP4B1Q9Y6B7 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
AP4B1Q9Y6B7 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
AP4B1Q9Y6B7 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
AP4B1Q9Y6B7 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
AP4B1Q9Y6B7 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
AP4B1Q9Y6B7 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
AP4B1Q9Y6B7 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
AP4B1Q9Y6B7 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
AP4B1Q9Y6B7 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
AP4B1Q9Y6B7 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
AP4B1Q9Y6B7 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
AP4B1Q9Y6B7 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
AP4B1Q9Y6B7 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
AP4B1Q9Y6B7 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
AP4B1Q9Y6B7 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
AP4B1Q9Y6B7 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
AP4B1Q9Y6B7 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
AP4B1Q9Y6B7 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
AP4B1Q9Y6B7 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
AP4B1Q9Y6B7 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
AP4B1Q9Y6B7 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
AP4B1Q9Y6B7 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
AP4B1Q9Y6B7 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
AP4B1Q9Y6B7 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
AP4B1Q9Y6B7 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
AP4B1Q9Y6B7 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
AP4B1Q9Y6B7 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
AP4B1Q9Y6B7 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
AP4B1Q9Y6B7 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
AP4B1Q9Y6B7 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
AP4B1Q9Y6B7 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
AP4B1Q9Y6B7 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
AP4B1Q9Y6B7 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
AP4B1Q9Y6B7 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
AP4B1Q9Y6B7 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
AP4B1Q9Y6B7 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
AP4B1Q9Y6B7 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
AP4B1Q9Y6B7 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
AP4B1Q9Y6B7 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
AP4B1Q9Y6B7 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
AP4B1Q9Y6B7 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
AP4B1Q9Y6B7 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
AP4B1Q9Y6B7 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
AP4B1Q9Y6B7 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
AP4B1Q9Y6B7 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
AP4B1Q9Y6B7 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
AP4B1Q9Y6B7 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
AP4B1Q9Y6B7 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
AP4B1Q9Y6B7 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
AP4B1Q9Y6B7 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
AP4B1Q9Y6B7 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
AP4B1Q9Y6B7 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.1 ms