Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI40

SLC24A2, Sodium/potassium/calcium exchanger 2, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC24A2Q9UI40 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SLC24A2Q9UI40 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SLC24A2Q9UI40 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SLC24A2Q9UI40 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SLC24A2Q9UI40 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SLC24A2Q9UI40 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SLC24A2Q9UI40 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SLC24A2Q9UI40 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SLC24A2Q9UI40 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SLC24A2Q9UI40 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SLC24A2Q9UI40 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SLC24A2Q9UI40 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SLC24A2Q9UI40 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SLC24A2Q9UI40 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SLC24A2Q9UI40 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SLC24A2Q9UI40 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SLC24A2Q9UI40 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SLC24A2Q9UI40 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SLC24A2Q9UI40 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SLC24A2Q9UI40 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
SLC24A2Q9UI40 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SLC24A2Q9UI40 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SLC24A2Q9UI40 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SLC24A2Q9UI40 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SLC24A2Q9UI40 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SLC24A2Q9UI40 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SLC24A2Q9UI40 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SLC24A2Q9UI40 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
SLC24A2Q9UI40 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SLC24A2Q9UI40 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SLC24A2Q9UI40 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SLC24A2Q9UI40 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SLC24A2Q9UI40 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SLC24A2Q9UI40 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SLC24A2Q9UI40 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SLC24A2Q9UI40 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SLC24A2Q9UI40 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SLC24A2Q9UI40 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SLC24A2Q9UI40 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SLC24A2Q9UI40 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SLC24A2Q9UI40 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SLC24A2Q9UI40 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SLC24A2Q9UI40 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SLC24A2Q9UI40 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SLC24A2Q9UI40 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SLC24A2Q9UI40 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SLC24A2Q9UI40 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SLC24A2Q9UI40 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SLC24A2Q9UI40 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SLC24A2Q9UI40 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SLC24A2Q9UI40 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SLC24A2Q9UI40 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SLC24A2Q9UI40 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SLC24A2Q9UI40 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SLC24A2Q9UI40 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
SLC24A2Q9UI40 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
SLC24A2Q9UI40 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SLC24A2Q9UI40 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SLC24A2Q9UI40 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SLC24A2Q9UI40 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SLC24A2Q9UI40 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SLC24A2Q9UI40 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SLC24A2Q9UI40 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SLC24A2Q9UI40 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SLC24A2Q9UI40 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SLC24A2Q9UI40 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SLC24A2Q9UI40 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SLC24A2Q9UI40 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SLC24A2Q9UI40 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SLC24A2Q9UI40 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SLC24A2Q9UI40 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SLC24A2Q9UI40 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SLC24A2Q9UI40 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SLC24A2Q9UI40 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SLC24A2Q9UI40 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SLC24A2Q9UI40 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SLC24A2Q9UI40 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SLC24A2Q9UI40 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SLC24A2Q9UI40 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
SLC24A2Q9UI40 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SLC24A2Q9UI40 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SLC24A2Q9UI40 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SLC24A2Q9UI40 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SLC24A2Q9UI40 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SLC24A2Q9UI40 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SLC24A2Q9UI40 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SLC24A2Q9UI40 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SLC24A2Q9UI40 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SLC24A2Q9UI40 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SLC24A2Q9UI40 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SLC24A2Q9UI40 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SLC24A2Q9UI40 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SLC24A2Q9UI40 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SLC24A2Q9UI40 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.13
SLC24A2Q9UI40 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
SLC24A2Q9UI40 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SLC24A2Q9UI40 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SLC24A2Q9UI40 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SLC24A2Q9UI40 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SLC24A2Q9UI40 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms