Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ43

USE1, Vesicle transport protein USE1, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USE1Q9NZ43 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
USE1Q9NZ43 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
USE1Q9NZ43 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
USE1Q9NZ43 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
USE1Q9NZ43 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
USE1Q9NZ43 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
USE1Q9NZ43 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
USE1Q9NZ43 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
USE1Q9NZ43 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
USE1Q9NZ43 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
USE1Q9NZ43 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
USE1Q9NZ43 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
USE1Q9NZ43 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
USE1Q9NZ43 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
USE1Q9NZ43 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
USE1Q9NZ43 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
USE1Q9NZ43 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
USE1Q9NZ43 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
USE1Q9NZ43 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
USE1Q9NZ43 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
USE1Q9NZ43 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
USE1Q9NZ43 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
USE1Q9NZ43 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
USE1Q9NZ43 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
USE1Q9NZ43 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
USE1Q9NZ43 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
USE1Q9NZ43 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
USE1Q9NZ43 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
USE1Q9NZ43 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
USE1Q9NZ43 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
USE1Q9NZ43 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
USE1Q9NZ43 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
USE1Q9NZ43 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
USE1Q9NZ43 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
USE1Q9NZ43 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
USE1Q9NZ43 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
USE1Q9NZ43 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
USE1Q9NZ43 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
USE1Q9NZ43 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
USE1Q9NZ43 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
USE1Q9NZ43 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
USE1Q9NZ43 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
USE1Q9NZ43 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
USE1Q9NZ43 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
USE1Q9NZ43 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
USE1Q9NZ43 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
USE1Q9NZ43 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
USE1Q9NZ43 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
USE1Q9NZ43 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
USE1Q9NZ43 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
USE1Q9NZ43 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
USE1Q9NZ43 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
USE1Q9NZ43 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
USE1Q9NZ43 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
USE1Q9NZ43 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
USE1Q9NZ43 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
USE1Q9NZ43 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
USE1Q9NZ43 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
USE1Q9NZ43 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
USE1Q9NZ43 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
USE1Q9NZ43 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
USE1Q9NZ43 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
USE1Q9NZ43 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
USE1Q9NZ43 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
USE1Q9NZ43 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
USE1Q9NZ43 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
USE1Q9NZ43 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
USE1Q9NZ43 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
USE1Q9NZ43 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
USE1Q9NZ43 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
USE1Q9NZ43 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
USE1Q9NZ43 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
USE1Q9NZ43 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
USE1Q9NZ43 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
USE1Q9NZ43 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
USE1Q9NZ43 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
USE1Q9NZ43 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
USE1Q9NZ43 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
USE1Q9NZ43 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
USE1Q9NZ43 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
USE1Q9NZ43 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
USE1Q9NZ43 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
USE1Q9NZ43 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
USE1Q9NZ43 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
USE1Q9NZ43 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
USE1Q9NZ43 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
USE1Q9NZ43 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
USE1Q9NZ43 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
USE1Q9NZ43 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
USE1Q9NZ43 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
USE1Q9NZ43 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
USE1Q9NZ43 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
USE1Q9NZ43 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
USE1Q9NZ43 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
USE1Q9NZ43 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
USE1Q9NZ43 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
USE1Q9NZ43 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
USE1Q9NZ43 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
USE1Q9NZ43 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
USE1Q9NZ43 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms