Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXR1

NDE1, Nuclear distribution protein nudE homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDE1Q9NXR1 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NDE1Q9NXR1 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NDE1Q9NXR1 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NDE1Q9NXR1 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NDE1Q9NXR1 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NDE1Q9NXR1 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NDE1Q9NXR1 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NDE1Q9NXR1 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NDE1Q9NXR1 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NDE1Q9NXR1 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NDE1Q9NXR1 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NDE1Q9NXR1 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NDE1Q9NXR1 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NDE1Q9NXR1 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NDE1Q9NXR1 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
NDE1Q9NXR1 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NDE1Q9NXR1 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NDE1Q9NXR1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NDE1Q9NXR1 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NDE1Q9NXR1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NDE1Q9NXR1 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NDE1Q9NXR1 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NDE1Q9NXR1 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NDE1Q9NXR1 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NDE1Q9NXR1 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NDE1Q9NXR1 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NDE1Q9NXR1 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NDE1Q9NXR1 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NDE1Q9NXR1 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NDE1Q9NXR1 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NDE1Q9NXR1 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
NDE1Q9NXR1 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
NDE1Q9NXR1 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NDE1Q9NXR1 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NDE1Q9NXR1 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NDE1Q9NXR1 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NDE1Q9NXR1 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NDE1Q9NXR1 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NDE1Q9NXR1 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NDE1Q9NXR1 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NDE1Q9NXR1 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NDE1Q9NXR1 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NDE1Q9NXR1 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NDE1Q9NXR1 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NDE1Q9NXR1 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NDE1Q9NXR1 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NDE1Q9NXR1 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NDE1Q9NXR1 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NDE1Q9NXR1 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NDE1Q9NXR1 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NDE1Q9NXR1 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NDE1Q9NXR1 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NDE1Q9NXR1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NDE1Q9NXR1 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NDE1Q9NXR1 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NDE1Q9NXR1 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NDE1Q9NXR1 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NDE1Q9NXR1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NDE1Q9NXR1 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NDE1Q9NXR1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NDE1Q9NXR1 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NDE1Q9NXR1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NDE1Q9NXR1 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NDE1Q9NXR1 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NDE1Q9NXR1 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NDE1Q9NXR1 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NDE1Q9NXR1 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NDE1Q9NXR1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NDE1Q9NXR1 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NDE1Q9NXR1 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NDE1Q9NXR1 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NDE1Q9NXR1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NDE1Q9NXR1 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NDE1Q9NXR1 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NDE1Q9NXR1 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NDE1Q9NXR1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NDE1Q9NXR1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NDE1Q9NXR1 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NDE1Q9NXR1 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NDE1Q9NXR1 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NDE1Q9NXR1 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NDE1Q9NXR1 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NDE1Q9NXR1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NDE1Q9NXR1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NDE1Q9NXR1 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NDE1Q9NXR1 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NDE1Q9NXR1 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NDE1Q9NXR1 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NDE1Q9NXR1 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NDE1Q9NXR1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
NDE1Q9NXR1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NDE1Q9NXR1 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
NDE1Q9NXR1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NDE1Q9NXR1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NDE1Q9NXR1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NDE1Q9NXR1 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NDE1Q9NXR1 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NDE1Q9NXR1 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NDE1Q9NXR1 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NDE1Q9NXR1 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.5 ms