Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV88

INTS9, Integrator complex subunit 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INTS9Q9NV88 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
INTS9Q9NV88 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
INTS9Q9NV88 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
INTS9Q9NV88 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
INTS9Q9NV88 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
INTS9Q9NV88 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
INTS9Q9NV88 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
INTS9Q9NV88 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
INTS9Q9NV88 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
INTS9Q9NV88 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
INTS9Q9NV88 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
INTS9Q9NV88 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
INTS9Q9NV88 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
INTS9Q9NV88 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
INTS9Q9NV88 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
INTS9Q9NV88 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
INTS9Q9NV88 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
INTS9Q9NV88 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
INTS9Q9NV88 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
INTS9Q9NV88 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
INTS9Q9NV88 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
INTS9Q9NV88 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
INTS9Q9NV88 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
INTS9Q9NV88 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
INTS9Q9NV88 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
INTS9Q9NV88 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
INTS9Q9NV88 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
INTS9Q9NV88 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
INTS9Q9NV88 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
INTS9Q9NV88 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
INTS9Q9NV88 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
INTS9Q9NV88 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
INTS9Q9NV88 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
INTS9Q9NV88 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
INTS9Q9NV88 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
INTS9Q9NV88 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
INTS9Q9NV88 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
INTS9Q9NV88 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
INTS9Q9NV88 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
INTS9Q9NV88 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
INTS9Q9NV88 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
INTS9Q9NV88 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
INTS9Q9NV88 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
INTS9Q9NV88 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
INTS9Q9NV88 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
INTS9Q9NV88 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
INTS9Q9NV88 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
INTS9Q9NV88 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
INTS9Q9NV88 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
INTS9Q9NV88 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
INTS9Q9NV88 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
INTS9Q9NV88 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
INTS9Q9NV88 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
INTS9Q9NV88 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
INTS9Q9NV88 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
INTS9Q9NV88 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
INTS9Q9NV88 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
INTS9Q9NV88 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
INTS9Q9NV88 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
INTS9Q9NV88 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
INTS9Q9NV88 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
INTS9Q9NV88 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
INTS9Q9NV88 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
INTS9Q9NV88 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
INTS9Q9NV88 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
INTS9Q9NV88 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
INTS9Q9NV88 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
INTS9Q9NV88 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
INTS9Q9NV88 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
INTS9Q9NV88 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
INTS9Q9NV88 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
INTS9Q9NV88 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
INTS9Q9NV88 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
INTS9Q9NV88 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
INTS9Q9NV88 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
INTS9Q9NV88 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
INTS9Q9NV88 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
INTS9Q9NV88 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
INTS9Q9NV88 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
INTS9Q9NV88 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
INTS9Q9NV88 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
INTS9Q9NV88 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
INTS9Q9NV88 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
INTS9Q9NV88 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
INTS9Q9NV88 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
INTS9Q9NV88 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
INTS9Q9NV88 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
INTS9Q9NV88 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
INTS9Q9NV88 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
INTS9Q9NV88 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
INTS9Q9NV88 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
INTS9Q9NV88 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
INTS9Q9NV88 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
INTS9Q9NV88 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
INTS9Q9NV88 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
INTS9Q9NV88 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
INTS9Q9NV88 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
INTS9Q9NV88 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
INTS9Q9NV88 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
INTS9Q9NV88 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms