Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS23

RASSF1, Ras association domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASSF1Q9NS23 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RASSF1Q9NS23 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RASSF1Q9NS23 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RASSF1Q9NS23 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RASSF1Q9NS23 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RASSF1Q9NS23 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RASSF1Q9NS23 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RASSF1Q9NS23 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RASSF1Q9NS23 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
RASSF1Q9NS23 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RASSF1Q9NS23 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RASSF1Q9NS23 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RASSF1Q9NS23 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RASSF1Q9NS23 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RASSF1Q9NS23 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RASSF1Q9NS23 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RASSF1Q9NS23 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RASSF1Q9NS23 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RASSF1Q9NS23 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RASSF1Q9NS23 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RASSF1Q9NS23 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RASSF1Q9NS23 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RASSF1Q9NS23 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
RASSF1Q9NS23 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RASSF1Q9NS23 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RASSF1Q9NS23 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RASSF1Q9NS23 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RASSF1Q9NS23 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RASSF1Q9NS23 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RASSF1Q9NS23 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
RASSF1Q9NS23 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RASSF1Q9NS23 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RASSF1Q9NS23 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RASSF1Q9NS23 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
RASSF1Q9NS23 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RASSF1Q9NS23 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RASSF1Q9NS23 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RASSF1Q9NS23 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
RASSF1Q9NS23 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RASSF1Q9NS23 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RASSF1Q9NS23 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RASSF1Q9NS23 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RASSF1Q9NS23 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RASSF1Q9NS23 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RASSF1Q9NS23 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RASSF1Q9NS23 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RASSF1Q9NS23 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RASSF1Q9NS23 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RASSF1Q9NS23 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RASSF1Q9NS23 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RASSF1Q9NS23 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RASSF1Q9NS23 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RASSF1Q9NS23 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RASSF1Q9NS23 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RASSF1Q9NS23 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RASSF1Q9NS23 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RASSF1Q9NS23 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RASSF1Q9NS23 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RASSF1Q9NS23 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RASSF1Q9NS23 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RASSF1Q9NS23 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RASSF1Q9NS23 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RASSF1Q9NS23 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RASSF1Q9NS23 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RASSF1Q9NS23 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RASSF1Q9NS23 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RASSF1Q9NS23 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RASSF1Q9NS23 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RASSF1Q9NS23 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
RASSF1Q9NS23 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
RASSF1Q9NS23 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RASSF1Q9NS23 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RASSF1Q9NS23 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RASSF1Q9NS23 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RASSF1Q9NS23 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RASSF1Q9NS23 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RASSF1Q9NS23 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RASSF1Q9NS23 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RASSF1Q9NS23 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RASSF1Q9NS23 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RASSF1Q9NS23 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RASSF1Q9NS23 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
RASSF1Q9NS23 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RASSF1Q9NS23 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RASSF1Q9NS23 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RASSF1Q9NS23 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RASSF1Q9NS23 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RASSF1Q9NS23 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RASSF1Q9NS23 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RASSF1Q9NS23 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RASSF1Q9NS23 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RASSF1Q9NS23 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RASSF1Q9NS23 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RASSF1Q9NS23 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RASSF1Q9NS23 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RASSF1Q9NS23 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RASSF1Q9NS23 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RASSF1Q9NS23 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RASSF1Q9NS23 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RASSF1Q9NS23 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.5 ms