Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR1

CYTL1, Cytokine-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTL1Q9NRR1 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CYTL1Q9NRR1 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CYTL1Q9NRR1 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CYTL1Q9NRR1 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CYTL1Q9NRR1 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CYTL1Q9NRR1 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CYTL1Q9NRR1 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CYTL1Q9NRR1 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CYTL1Q9NRR1 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CYTL1Q9NRR1 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CYTL1Q9NRR1 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CYTL1Q9NRR1 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CYTL1Q9NRR1 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CYTL1Q9NRR1 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CYTL1Q9NRR1 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CYTL1Q9NRR1 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CYTL1Q9NRR1 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CYTL1Q9NRR1 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CYTL1Q9NRR1 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CYTL1Q9NRR1 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CYTL1Q9NRR1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CYTL1Q9NRR1 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CYTL1Q9NRR1 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CYTL1Q9NRR1 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CYTL1Q9NRR1 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CYTL1Q9NRR1 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CYTL1Q9NRR1 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CYTL1Q9NRR1 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYTL1Q9NRR1 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYTL1Q9NRR1 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYTL1Q9NRR1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYTL1Q9NRR1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CYTL1Q9NRR1 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CYTL1Q9NRR1 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CYTL1Q9NRR1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CYTL1Q9NRR1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CYTL1Q9NRR1 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CYTL1Q9NRR1 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CYTL1Q9NRR1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CYTL1Q9NRR1 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CYTL1Q9NRR1 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CYTL1Q9NRR1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CYTL1Q9NRR1 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CYTL1Q9NRR1 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CYTL1Q9NRR1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYTL1Q9NRR1 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYTL1Q9NRR1 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYTL1Q9NRR1 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYTL1Q9NRR1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYTL1Q9NRR1 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CYTL1Q9NRR1 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CYTL1Q9NRR1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CYTL1Q9NRR1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CYTL1Q9NRR1 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CYTL1Q9NRR1 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CYTL1Q9NRR1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CYTL1Q9NRR1 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CYTL1Q9NRR1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CYTL1Q9NRR1 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CYTL1Q9NRR1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CYTL1Q9NRR1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CYTL1Q9NRR1 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CYTL1Q9NRR1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CYTL1Q9NRR1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CYTL1Q9NRR1 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CYTL1Q9NRR1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CYTL1Q9NRR1 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CYTL1Q9NRR1 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CYTL1Q9NRR1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CYTL1Q9NRR1 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CYTL1Q9NRR1 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CYTL1Q9NRR1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CYTL1Q9NRR1 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CYTL1Q9NRR1 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CYTL1Q9NRR1 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CYTL1Q9NRR1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CYTL1Q9NRR1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CYTL1Q9NRR1 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CYTL1Q9NRR1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CYTL1Q9NRR1 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CYTL1Q9NRR1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CYTL1Q9NRR1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CYTL1Q9NRR1 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CYTL1Q9NRR1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CYTL1Q9NRR1 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CYTL1Q9NRR1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
CYTL1Q9NRR1 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CYTL1Q9NRR1 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CYTL1Q9NRR1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CYTL1Q9NRR1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CYTL1Q9NRR1 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CYTL1Q9NRR1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CYTL1Q9NRR1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CYTL1Q9NRR1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CYTL1Q9NRR1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CYTL1Q9NRR1 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CYTL1Q9NRR1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CYTL1Q9NRR1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CYTL1Q9NRR1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CYTL1Q9NRR1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms