Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR61

DLL4, Delta-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DLL4Q9NR61 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DLL4Q9NR61 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DLL4Q9NR61 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DLL4Q9NR61 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DLL4Q9NR61 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DLL4Q9NR61 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
DLL4Q9NR61 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DLL4Q9NR61 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DLL4Q9NR61 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
DLL4Q9NR61 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DLL4Q9NR61 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DLL4Q9NR61 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DLL4Q9NR61 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DLL4Q9NR61 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DLL4Q9NR61 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DLL4Q9NR61 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DLL4Q9NR61 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DLL4Q9NR61 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DLL4Q9NR61 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DLL4Q9NR61 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DLL4Q9NR61 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DLL4Q9NR61 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DLL4Q9NR61 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DLL4Q9NR61 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DLL4Q9NR61 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DLL4Q9NR61 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DLL4Q9NR61 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DLL4Q9NR61 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DLL4Q9NR61 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DLL4Q9NR61 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DLL4Q9NR61 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
DLL4Q9NR61 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DLL4Q9NR61 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
DLL4Q9NR61 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DLL4Q9NR61 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DLL4Q9NR61 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DLL4Q9NR61 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DLL4Q9NR61 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DLL4Q9NR61 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DLL4Q9NR61 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DLL4Q9NR61 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DLL4Q9NR61 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DLL4Q9NR61 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DLL4Q9NR61 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DLL4Q9NR61 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
DLL4Q9NR61 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DLL4Q9NR61 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DLL4Q9NR61 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
DLL4Q9NR61 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
DLL4Q9NR61 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
DLL4Q9NR61 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
DLL4Q9NR61 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DLL4Q9NR61 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DLL4Q9NR61 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
DLL4Q9NR61 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
DLL4Q9NR61 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DLL4Q9NR61 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DLL4Q9NR61 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
DLL4Q9NR61 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DLL4Q9NR61 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DLL4Q9NR61 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
DLL4Q9NR61 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DLL4Q9NR61 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DLL4Q9NR61 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DLL4Q9NR61 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
DLL4Q9NR61 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
DLL4Q9NR61 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DLL4Q9NR61 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DLL4Q9NR61 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DLL4Q9NR61 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DLL4Q9NR61 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DLL4Q9NR61 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DLL4Q9NR61 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DLL4Q9NR61 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DLL4Q9NR61 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DLL4Q9NR61 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DLL4Q9NR61 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DLL4Q9NR61 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DLL4Q9NR61 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DLL4Q9NR61 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DLL4Q9NR61 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DLL4Q9NR61 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DLL4Q9NR61 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DLL4Q9NR61 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
DLL4Q9NR61 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DLL4Q9NR61 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DLL4Q9NR61 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DLL4Q9NR61 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DLL4Q9NR61 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DLL4Q9NR61 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
DLL4Q9NR61 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
DLL4Q9NR61 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DLL4Q9NR61 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DLL4Q9NR61 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
DLL4Q9NR61 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DLL4Q9NR61 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DLL4Q9NR61 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DLL4Q9NR61 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DLL4Q9NR61 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
DLL4Q9NR61 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms