Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3S4

TPK1, Thiamin pyrophosphokinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPK1Q9H3S4 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TPK1Q9H3S4 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TPK1Q9H3S4 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TPK1Q9H3S4 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TPK1Q9H3S4 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TPK1Q9H3S4 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TPK1Q9H3S4 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TPK1Q9H3S4 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TPK1Q9H3S4 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TPK1Q9H3S4 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TPK1Q9H3S4 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TPK1Q9H3S4 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TPK1Q9H3S4 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TPK1Q9H3S4 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TPK1Q9H3S4 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TPK1Q9H3S4 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TPK1Q9H3S4 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TPK1Q9H3S4 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TPK1Q9H3S4 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TPK1Q9H3S4 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TPK1Q9H3S4 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TPK1Q9H3S4 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
TPK1Q9H3S4 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TPK1Q9H3S4 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TPK1Q9H3S4 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TPK1Q9H3S4 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TPK1Q9H3S4 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TPK1Q9H3S4 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TPK1Q9H3S4 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TPK1Q9H3S4 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TPK1Q9H3S4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
TPK1Q9H3S4 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TPK1Q9H3S4 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TPK1Q9H3S4 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TPK1Q9H3S4 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TPK1Q9H3S4 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TPK1Q9H3S4 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TPK1Q9H3S4 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TPK1Q9H3S4 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TPK1Q9H3S4 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
TPK1Q9H3S4 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TPK1Q9H3S4 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TPK1Q9H3S4 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TPK1Q9H3S4 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TPK1Q9H3S4 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TPK1Q9H3S4 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
TPK1Q9H3S4 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TPK1Q9H3S4 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TPK1Q9H3S4 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TPK1Q9H3S4 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TPK1Q9H3S4 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TPK1Q9H3S4 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TPK1Q9H3S4 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TPK1Q9H3S4 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TPK1Q9H3S4 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TPK1Q9H3S4 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TPK1Q9H3S4 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TPK1Q9H3S4 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TPK1Q9H3S4 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TPK1Q9H3S4 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TPK1Q9H3S4 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TPK1Q9H3S4 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TPK1Q9H3S4 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TPK1Q9H3S4 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TPK1Q9H3S4 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TPK1Q9H3S4 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
TPK1Q9H3S4 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TPK1Q9H3S4 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TPK1Q9H3S4 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TPK1Q9H3S4 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TPK1Q9H3S4 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TPK1Q9H3S4 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TPK1Q9H3S4 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TPK1Q9H3S4 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TPK1Q9H3S4 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TPK1Q9H3S4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TPK1Q9H3S4 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TPK1Q9H3S4 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TPK1Q9H3S4 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TPK1Q9H3S4 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TPK1Q9H3S4 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TPK1Q9H3S4 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TPK1Q9H3S4 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TPK1Q9H3S4 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TPK1Q9H3S4 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TPK1Q9H3S4 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TPK1Q9H3S4 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TPK1Q9H3S4 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TPK1Q9H3S4 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TPK1Q9H3S4 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TPK1Q9H3S4 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TPK1Q9H3S4 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TPK1Q9H3S4 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TPK1Q9H3S4 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TPK1Q9H3S4 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TPK1Q9H3S4 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TPK1Q9H3S4 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TPK1Q9H3S4 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TPK1Q9H3S4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TPK1Q9H3S4 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.7 ms