Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2E6

SEMA6A, Semaphorin-6A, humanhuman

Predictions only

Length 1,030 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6AQ9H2E6 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SEMA6AQ9H2E6 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SEMA6AQ9H2E6 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SEMA6AQ9H2E6 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SEMA6AQ9H2E6 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SEMA6AQ9H2E6 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SEMA6AQ9H2E6 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SEMA6AQ9H2E6 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SEMA6AQ9H2E6 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SEMA6AQ9H2E6 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SEMA6AQ9H2E6 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SEMA6AQ9H2E6 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SEMA6AQ9H2E6 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SEMA6AQ9H2E6 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SEMA6AQ9H2E6 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SEMA6AQ9H2E6 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SEMA6AQ9H2E6 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SEMA6AQ9H2E6 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SEMA6AQ9H2E6 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SEMA6AQ9H2E6 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SEMA6AQ9H2E6 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SEMA6AQ9H2E6 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SEMA6AQ9H2E6 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SEMA6AQ9H2E6 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SEMA6AQ9H2E6 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SEMA6AQ9H2E6 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SEMA6AQ9H2E6 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
SEMA6AQ9H2E6 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SEMA6AQ9H2E6 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SEMA6AQ9H2E6 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SEMA6AQ9H2E6 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SEMA6AQ9H2E6 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SEMA6AQ9H2E6 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SEMA6AQ9H2E6 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SEMA6AQ9H2E6 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SEMA6AQ9H2E6 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SEMA6AQ9H2E6 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SEMA6AQ9H2E6 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SEMA6AQ9H2E6 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SEMA6AQ9H2E6 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SEMA6AQ9H2E6 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SEMA6AQ9H2E6 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SEMA6AQ9H2E6 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SEMA6AQ9H2E6 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SEMA6AQ9H2E6 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SEMA6AQ9H2E6 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SEMA6AQ9H2E6 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SEMA6AQ9H2E6 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SEMA6AQ9H2E6 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SEMA6AQ9H2E6 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SEMA6AQ9H2E6 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SEMA6AQ9H2E6 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SEMA6AQ9H2E6 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SEMA6AQ9H2E6 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SEMA6AQ9H2E6 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SEMA6AQ9H2E6 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SEMA6AQ9H2E6 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SEMA6AQ9H2E6 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SEMA6AQ9H2E6 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SEMA6AQ9H2E6 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SEMA6AQ9H2E6 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SEMA6AQ9H2E6 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SEMA6AQ9H2E6 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SEMA6AQ9H2E6 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SEMA6AQ9H2E6 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SEMA6AQ9H2E6 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SEMA6AQ9H2E6 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SEMA6AQ9H2E6 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SEMA6AQ9H2E6 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SEMA6AQ9H2E6 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SEMA6AQ9H2E6 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SEMA6AQ9H2E6 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SEMA6AQ9H2E6 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SEMA6AQ9H2E6 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SEMA6AQ9H2E6 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SEMA6AQ9H2E6 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SEMA6AQ9H2E6 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SEMA6AQ9H2E6 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SEMA6AQ9H2E6 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SEMA6AQ9H2E6 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SEMA6AQ9H2E6 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SEMA6AQ9H2E6 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SEMA6AQ9H2E6 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SEMA6AQ9H2E6 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SEMA6AQ9H2E6 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SEMA6AQ9H2E6 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SEMA6AQ9H2E6 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SEMA6AQ9H2E6 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SEMA6AQ9H2E6 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SEMA6AQ9H2E6 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SEMA6AQ9H2E6 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
SEMA6AQ9H2E6 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SEMA6AQ9H2E6 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SEMA6AQ9H2E6 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SEMA6AQ9H2E6 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SEMA6AQ9H2E6 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SEMA6AQ9H2E6 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SEMA6AQ9H2E6 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SEMA6AQ9H2E6 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SEMA6AQ9H2E6 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107 ms