Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT67

NDFIP1, NEDD4 family-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDFIP1Q9BT67 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
NDFIP1Q9BT67 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NDFIP1Q9BT67 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NDFIP1Q9BT67 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NDFIP1Q9BT67 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NDFIP1Q9BT67 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NDFIP1Q9BT67 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NDFIP1Q9BT67 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
NDFIP1Q9BT67 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
NDFIP1Q9BT67 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NDFIP1Q9BT67 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NDFIP1Q9BT67 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NDFIP1Q9BT67 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NDFIP1Q9BT67 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NDFIP1Q9BT67 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NDFIP1Q9BT67 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NDFIP1Q9BT67 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NDFIP1Q9BT67 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NDFIP1Q9BT67 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NDFIP1Q9BT67 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NDFIP1Q9BT67 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NDFIP1Q9BT67 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NDFIP1Q9BT67 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NDFIP1Q9BT67 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NDFIP1Q9BT67 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NDFIP1Q9BT67 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NDFIP1Q9BT67 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NDFIP1Q9BT67 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
NDFIP1Q9BT67 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NDFIP1Q9BT67 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NDFIP1Q9BT67 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NDFIP1Q9BT67 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NDFIP1Q9BT67 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NDFIP1Q9BT67 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NDFIP1Q9BT67 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NDFIP1Q9BT67 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NDFIP1Q9BT67 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NDFIP1Q9BT67 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NDFIP1Q9BT67 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NDFIP1Q9BT67 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
NDFIP1Q9BT67 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NDFIP1Q9BT67 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NDFIP1Q9BT67 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NDFIP1Q9BT67 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NDFIP1Q9BT67 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NDFIP1Q9BT67 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NDFIP1Q9BT67 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NDFIP1Q9BT67 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NDFIP1Q9BT67 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NDFIP1Q9BT67 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NDFIP1Q9BT67 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NDFIP1Q9BT67 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NDFIP1Q9BT67 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NDFIP1Q9BT67 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NDFIP1Q9BT67 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NDFIP1Q9BT67 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NDFIP1Q9BT67 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NDFIP1Q9BT67 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NDFIP1Q9BT67 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NDFIP1Q9BT67 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NDFIP1Q9BT67 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NDFIP1Q9BT67 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NDFIP1Q9BT67 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NDFIP1Q9BT67 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NDFIP1Q9BT67 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NDFIP1Q9BT67 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NDFIP1Q9BT67 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NDFIP1Q9BT67 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NDFIP1Q9BT67 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NDFIP1Q9BT67 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NDFIP1Q9BT67 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NDFIP1Q9BT67 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NDFIP1Q9BT67 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
NDFIP1Q9BT67 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NDFIP1Q9BT67 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
NDFIP1Q9BT67 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
NDFIP1Q9BT67 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
NDFIP1Q9BT67 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NDFIP1Q9BT67 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NDFIP1Q9BT67 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NDFIP1Q9BT67 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NDFIP1Q9BT67 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NDFIP1Q9BT67 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NDFIP1Q9BT67 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NDFIP1Q9BT67 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NDFIP1Q9BT67 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NDFIP1Q9BT67 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NDFIP1Q9BT67 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NDFIP1Q9BT67 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
NDFIP1Q9BT67 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NDFIP1Q9BT67 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NDFIP1Q9BT67 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NDFIP1Q9BT67 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NDFIP1Q9BT67 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NDFIP1Q9BT67 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NDFIP1Q9BT67 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NDFIP1Q9BT67 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NDFIP1Q9BT67 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NDFIP1Q9BT67 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NDFIP1Q9BT67 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.1 ms