Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT67

NDFIP1, NEDD4 family-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDFIP1Q9BT67 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
NDFIP1Q9BT67 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NDFIP1Q9BT67 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NDFIP1Q9BT67 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NDFIP1Q9BT67 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NDFIP1Q9BT67 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NDFIP1Q9BT67 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NDFIP1Q9BT67 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
NDFIP1Q9BT67 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
NDFIP1Q9BT67 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NDFIP1Q9BT67 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NDFIP1Q9BT67 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NDFIP1Q9BT67 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NDFIP1Q9BT67 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NDFIP1Q9BT67 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NDFIP1Q9BT67 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NDFIP1Q9BT67 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NDFIP1Q9BT67 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NDFIP1Q9BT67 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NDFIP1Q9BT67 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NDFIP1Q9BT67 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NDFIP1Q9BT67 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NDFIP1Q9BT67 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NDFIP1Q9BT67 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NDFIP1Q9BT67 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NDFIP1Q9BT67 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NDFIP1Q9BT67 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NDFIP1Q9BT67 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
NDFIP1Q9BT67 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NDFIP1Q9BT67 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NDFIP1Q9BT67 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NDFIP1Q9BT67 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NDFIP1Q9BT67 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NDFIP1Q9BT67 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NDFIP1Q9BT67 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NDFIP1Q9BT67 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NDFIP1Q9BT67 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NDFIP1Q9BT67 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NDFIP1Q9BT67 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NDFIP1Q9BT67 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
NDFIP1Q9BT67 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NDFIP1Q9BT67 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NDFIP1Q9BT67 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NDFIP1Q9BT67 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NDFIP1Q9BT67 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NDFIP1Q9BT67 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NDFIP1Q9BT67 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NDFIP1Q9BT67 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NDFIP1Q9BT67 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NDFIP1Q9BT67 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NDFIP1Q9BT67 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NDFIP1Q9BT67 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NDFIP1Q9BT67 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NDFIP1Q9BT67 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NDFIP1Q9BT67 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NDFIP1Q9BT67 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NDFIP1Q9BT67 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NDFIP1Q9BT67 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NDFIP1Q9BT67 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NDFIP1Q9BT67 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NDFIP1Q9BT67 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NDFIP1Q9BT67 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NDFIP1Q9BT67 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NDFIP1Q9BT67 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NDFIP1Q9BT67 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NDFIP1Q9BT67 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NDFIP1Q9BT67 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NDFIP1Q9BT67 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NDFIP1Q9BT67 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NDFIP1Q9BT67 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NDFIP1Q9BT67 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NDFIP1Q9BT67 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NDFIP1Q9BT67 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
NDFIP1Q9BT67 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NDFIP1Q9BT67 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
NDFIP1Q9BT67 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
NDFIP1Q9BT67 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
NDFIP1Q9BT67 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NDFIP1Q9BT67 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NDFIP1Q9BT67 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NDFIP1Q9BT67 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NDFIP1Q9BT67 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NDFIP1Q9BT67 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NDFIP1Q9BT67 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NDFIP1Q9BT67 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NDFIP1Q9BT67 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NDFIP1Q9BT67 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NDFIP1Q9BT67 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NDFIP1Q9BT67 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
NDFIP1Q9BT67 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NDFIP1Q9BT67 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NDFIP1Q9BT67 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NDFIP1Q9BT67 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NDFIP1Q9BT67 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NDFIP1Q9BT67 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NDFIP1Q9BT67 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NDFIP1Q9BT67 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NDFIP1Q9BT67 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NDFIP1Q9BT67 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NDFIP1Q9BT67 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.5 ms