Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT67

NDFIP1, NEDD4 family-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDFIP1Q9BT67 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
NDFIP1Q9BT67 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NDFIP1Q9BT67 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NDFIP1Q9BT67 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NDFIP1Q9BT67 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NDFIP1Q9BT67 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NDFIP1Q9BT67 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NDFIP1Q9BT67 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
NDFIP1Q9BT67 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NDFIP1Q9BT67 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NDFIP1Q9BT67 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NDFIP1Q9BT67 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NDFIP1Q9BT67 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NDFIP1Q9BT67 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NDFIP1Q9BT67 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NDFIP1Q9BT67 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NDFIP1Q9BT67 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NDFIP1Q9BT67 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NDFIP1Q9BT67 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NDFIP1Q9BT67 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NDFIP1Q9BT67 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NDFIP1Q9BT67 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NDFIP1Q9BT67 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NDFIP1Q9BT67 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NDFIP1Q9BT67 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
NDFIP1Q9BT67 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NDFIP1Q9BT67 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NDFIP1Q9BT67 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NDFIP1Q9BT67 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NDFIP1Q9BT67 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NDFIP1Q9BT67 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NDFIP1Q9BT67 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NDFIP1Q9BT67 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NDFIP1Q9BT67 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NDFIP1Q9BT67 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NDFIP1Q9BT67 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NDFIP1Q9BT67 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NDFIP1Q9BT67 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NDFIP1Q9BT67 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NDFIP1Q9BT67 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NDFIP1Q9BT67 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NDFIP1Q9BT67 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NDFIP1Q9BT67 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NDFIP1Q9BT67 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NDFIP1Q9BT67 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NDFIP1Q9BT67 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NDFIP1Q9BT67 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NDFIP1Q9BT67 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NDFIP1Q9BT67 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NDFIP1Q9BT67 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NDFIP1Q9BT67 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NDFIP1Q9BT67 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NDFIP1Q9BT67 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NDFIP1Q9BT67 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NDFIP1Q9BT67 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NDFIP1Q9BT67 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NDFIP1Q9BT67 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NDFIP1Q9BT67 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NDFIP1Q9BT67 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NDFIP1Q9BT67 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NDFIP1Q9BT67 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NDFIP1Q9BT67 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NDFIP1Q9BT67 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NDFIP1Q9BT67 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NDFIP1Q9BT67 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NDFIP1Q9BT67 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NDFIP1Q9BT67 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NDFIP1Q9BT67 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NDFIP1Q9BT67 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NDFIP1Q9BT67 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NDFIP1Q9BT67 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NDFIP1Q9BT67 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NDFIP1Q9BT67 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NDFIP1Q9BT67 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NDFIP1Q9BT67 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NDFIP1Q9BT67 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NDFIP1Q9BT67 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NDFIP1Q9BT67 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NDFIP1Q9BT67 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NDFIP1Q9BT67 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NDFIP1Q9BT67 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NDFIP1Q9BT67 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDFIP1Q9BT67 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDFIP1Q9BT67 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDFIP1Q9BT67 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDFIP1Q9BT67 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NDFIP1Q9BT67 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDFIP1Q9BT67 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NDFIP1Q9BT67 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NDFIP1Q9BT67 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NDFIP1Q9BT67 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NDFIP1Q9BT67 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NDFIP1Q9BT67 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NDFIP1Q9BT67 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NDFIP1Q9BT67 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NDFIP1Q9BT67 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NDFIP1Q9BT67 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NDFIP1Q9BT67 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NDFIP1Q9BT67 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NDFIP1Q9BT67 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.1 ms