Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSG0

PRADC1, Protease-associated domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRADC1Q9BSG0 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PRADC1Q9BSG0 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PRADC1Q9BSG0 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PRADC1Q9BSG0 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PRADC1Q9BSG0 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
PRADC1Q9BSG0 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PRADC1Q9BSG0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PRADC1Q9BSG0 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PRADC1Q9BSG0 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PRADC1Q9BSG0 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PRADC1Q9BSG0 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PRADC1Q9BSG0 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PRADC1Q9BSG0 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PRADC1Q9BSG0 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PRADC1Q9BSG0 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PRADC1Q9BSG0 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PRADC1Q9BSG0 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PRADC1Q9BSG0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PRADC1Q9BSG0 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PRADC1Q9BSG0 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PRADC1Q9BSG0 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PRADC1Q9BSG0 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRADC1Q9BSG0 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PRADC1Q9BSG0 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRADC1Q9BSG0 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRADC1Q9BSG0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRADC1Q9BSG0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRADC1Q9BSG0 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRADC1Q9BSG0 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRADC1Q9BSG0 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRADC1Q9BSG0 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PRADC1Q9BSG0 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PRADC1Q9BSG0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PRADC1Q9BSG0 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PRADC1Q9BSG0 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRADC1Q9BSG0 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRADC1Q9BSG0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRADC1Q9BSG0 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRADC1Q9BSG0 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRADC1Q9BSG0 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRADC1Q9BSG0 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRADC1Q9BSG0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRADC1Q9BSG0 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PRADC1Q9BSG0 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRADC1Q9BSG0 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRADC1Q9BSG0 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRADC1Q9BSG0 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRADC1Q9BSG0 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRADC1Q9BSG0 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRADC1Q9BSG0 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRADC1Q9BSG0 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PRADC1Q9BSG0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRADC1Q9BSG0 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRADC1Q9BSG0 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRADC1Q9BSG0 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRADC1Q9BSG0 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRADC1Q9BSG0 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRADC1Q9BSG0 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRADC1Q9BSG0 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRADC1Q9BSG0 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRADC1Q9BSG0 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRADC1Q9BSG0 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRADC1Q9BSG0 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRADC1Q9BSG0 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PRADC1Q9BSG0 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRADC1Q9BSG0 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRADC1Q9BSG0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRADC1Q9BSG0 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRADC1Q9BSG0 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRADC1Q9BSG0 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRADC1Q9BSG0 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRADC1Q9BSG0 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRADC1Q9BSG0 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRADC1Q9BSG0 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRADC1Q9BSG0 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRADC1Q9BSG0 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRADC1Q9BSG0 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRADC1Q9BSG0 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRADC1Q9BSG0 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PRADC1Q9BSG0 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRADC1Q9BSG0 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRADC1Q9BSG0 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRADC1Q9BSG0 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRADC1Q9BSG0 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRADC1Q9BSG0 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRADC1Q9BSG0 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRADC1Q9BSG0 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRADC1Q9BSG0 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRADC1Q9BSG0 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRADC1Q9BSG0 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PRADC1Q9BSG0 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRADC1Q9BSG0 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PRADC1Q9BSG0 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PRADC1Q9BSG0 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PRADC1Q9BSG0 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PRADC1Q9BSG0 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PRADC1Q9BSG0 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PRADC1Q9BSG0 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PRADC1Q9BSG0 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PRADC1Q9BSG0 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms