Protein–RNA interactions for Protein: Q99496

RNF2, E3 ubiquitin-protein ligase RING2, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF2Q99496 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF2Q99496 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF2Q99496 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF2Q99496 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RNF2Q99496 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RNF2Q99496 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RNF2Q99496 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RNF2Q99496 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
RNF2Q99496 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RNF2Q99496 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RNF2Q99496 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RNF2Q99496 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RNF2Q99496 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RNF2Q99496 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF2Q99496 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF2Q99496 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF2Q99496 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF2Q99496 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF2Q99496 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF2Q99496 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF2Q99496 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF2Q99496 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF2Q99496 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF2Q99496 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF2Q99496 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF2Q99496 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF2Q99496 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF2Q99496 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF2Q99496 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF2Q99496 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF2Q99496 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF2Q99496 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RNF2Q99496 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RNF2Q99496 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF2Q99496 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF2Q99496 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF2Q99496 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF2Q99496 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF2Q99496 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF2Q99496 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF2Q99496 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF2Q99496 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF2Q99496 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF2Q99496 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF2Q99496 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF2Q99496 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF2Q99496 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF2Q99496 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF2Q99496 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF2Q99496 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF2Q99496 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF2Q99496 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF2Q99496 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF2Q99496 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF2Q99496 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF2Q99496 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF2Q99496 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF2Q99496 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF2Q99496 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF2Q99496 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF2Q99496 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF2Q99496 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF2Q99496 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RNF2Q99496 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RNF2Q99496 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF2Q99496 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF2Q99496 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF2Q99496 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF2Q99496 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF2Q99496 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF2Q99496 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF2Q99496 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF2Q99496 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF2Q99496 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF2Q99496 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF2Q99496 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF2Q99496 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF2Q99496 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF2Q99496 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF2Q99496 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF2Q99496 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF2Q99496 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
RNF2Q99496 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RNF2Q99496 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RNF2Q99496 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RNF2Q99496 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RNF2Q99496 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF2Q99496 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF2Q99496 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF2Q99496 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF2Q99496 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF2Q99496 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF2Q99496 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF2Q99496 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF2Q99496 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
RNF2Q99496 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
RNF2Q99496 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RNF2Q99496 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RNF2Q99496 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RNF2Q99496 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms