Protein–RNA interactions for Protein: Q96QP1

ALPK1, Alpha-protein kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALPK1Q96QP1 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ALPK1Q96QP1 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
ALPK1Q96QP1 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ALPK1Q96QP1 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ALPK1Q96QP1 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ALPK1Q96QP1 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ALPK1Q96QP1 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ALPK1Q96QP1 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ALPK1Q96QP1 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ALPK1Q96QP1 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ALPK1Q96QP1 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ALPK1Q96QP1 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ALPK1Q96QP1 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ALPK1Q96QP1 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ALPK1Q96QP1 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ALPK1Q96QP1 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ALPK1Q96QP1 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
ALPK1Q96QP1 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ALPK1Q96QP1 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ALPK1Q96QP1 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ALPK1Q96QP1 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ALPK1Q96QP1 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ALPK1Q96QP1 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ALPK1Q96QP1 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
ALPK1Q96QP1 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ALPK1Q96QP1 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ALPK1Q96QP1 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ALPK1Q96QP1 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ALPK1Q96QP1 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ALPK1Q96QP1 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ALPK1Q96QP1 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ALPK1Q96QP1 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ALPK1Q96QP1 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ALPK1Q96QP1 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ALPK1Q96QP1 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ALPK1Q96QP1 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ALPK1Q96QP1 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ALPK1Q96QP1 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ALPK1Q96QP1 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ALPK1Q96QP1 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
ALPK1Q96QP1 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ALPK1Q96QP1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ALPK1Q96QP1 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ALPK1Q96QP1 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ALPK1Q96QP1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
ALPK1Q96QP1 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ALPK1Q96QP1 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ALPK1Q96QP1 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ALPK1Q96QP1 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ALPK1Q96QP1 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ALPK1Q96QP1 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ALPK1Q96QP1 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ALPK1Q96QP1 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ALPK1Q96QP1 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ALPK1Q96QP1 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ALPK1Q96QP1 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ALPK1Q96QP1 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ALPK1Q96QP1 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ALPK1Q96QP1 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ALPK1Q96QP1 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ALPK1Q96QP1 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
ALPK1Q96QP1 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ALPK1Q96QP1 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ALPK1Q96QP1 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ALPK1Q96QP1 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
ALPK1Q96QP1 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ALPK1Q96QP1 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ALPK1Q96QP1 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ALPK1Q96QP1 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ALPK1Q96QP1 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ALPK1Q96QP1 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ALPK1Q96QP1 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ALPK1Q96QP1 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ALPK1Q96QP1 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ALPK1Q96QP1 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ALPK1Q96QP1 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ALPK1Q96QP1 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ALPK1Q96QP1 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ALPK1Q96QP1 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ALPK1Q96QP1 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ALPK1Q96QP1 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ALPK1Q96QP1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ALPK1Q96QP1 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ALPK1Q96QP1 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ALPK1Q96QP1 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ALPK1Q96QP1 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ALPK1Q96QP1 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ALPK1Q96QP1 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ALPK1Q96QP1 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ALPK1Q96QP1 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
ALPK1Q96QP1 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ALPK1Q96QP1 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ALPK1Q96QP1 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ALPK1Q96QP1 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ALPK1Q96QP1 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ALPK1Q96QP1 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ALPK1Q96QP1 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ALPK1Q96QP1 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ALPK1Q96QP1 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ALPK1Q96QP1 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms