Protein–RNA interactions for Protein: Q96M20

CNBD2, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD2Q96M20 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CNBD2Q96M20 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CNBD2Q96M20 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CNBD2Q96M20 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CNBD2Q96M20 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CNBD2Q96M20 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CNBD2Q96M20 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CNBD2Q96M20 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CNBD2Q96M20 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CNBD2Q96M20 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CNBD2Q96M20 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CNBD2Q96M20 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CNBD2Q96M20 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CNBD2Q96M20 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CNBD2Q96M20 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
CNBD2Q96M20 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CNBD2Q96M20 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CNBD2Q96M20 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CNBD2Q96M20 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CNBD2Q96M20 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CNBD2Q96M20 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CNBD2Q96M20 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CNBD2Q96M20 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CNBD2Q96M20 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CNBD2Q96M20 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CNBD2Q96M20 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CNBD2Q96M20 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CNBD2Q96M20 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CNBD2Q96M20 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CNBD2Q96M20 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CNBD2Q96M20 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CNBD2Q96M20 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CNBD2Q96M20 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CNBD2Q96M20 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CNBD2Q96M20 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CNBD2Q96M20 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CNBD2Q96M20 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CNBD2Q96M20 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CNBD2Q96M20 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CNBD2Q96M20 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CNBD2Q96M20 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CNBD2Q96M20 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CNBD2Q96M20 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CNBD2Q96M20 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CNBD2Q96M20 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CNBD2Q96M20 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CNBD2Q96M20 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CNBD2Q96M20 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CNBD2Q96M20 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CNBD2Q96M20 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CNBD2Q96M20 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CNBD2Q96M20 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CNBD2Q96M20 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CNBD2Q96M20 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CNBD2Q96M20 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CNBD2Q96M20 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CNBD2Q96M20 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CNBD2Q96M20 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CNBD2Q96M20 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CNBD2Q96M20 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CNBD2Q96M20 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CNBD2Q96M20 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CNBD2Q96M20 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CNBD2Q96M20 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CNBD2Q96M20 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CNBD2Q96M20 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CNBD2Q96M20 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CNBD2Q96M20 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CNBD2Q96M20 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CNBD2Q96M20 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CNBD2Q96M20 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CNBD2Q96M20 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CNBD2Q96M20 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CNBD2Q96M20 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CNBD2Q96M20 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CNBD2Q96M20 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CNBD2Q96M20 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CNBD2Q96M20 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
CNBD2Q96M20 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CNBD2Q96M20 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CNBD2Q96M20 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
CNBD2Q96M20 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CNBD2Q96M20 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CNBD2Q96M20 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CNBD2Q96M20 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CNBD2Q96M20 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CNBD2Q96M20 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CNBD2Q96M20 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CNBD2Q96M20 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CNBD2Q96M20 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CNBD2Q96M20 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CNBD2Q96M20 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CNBD2Q96M20 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CNBD2Q96M20 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CNBD2Q96M20 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CNBD2Q96M20 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CNBD2Q96M20 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CNBD2Q96M20 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CNBD2Q96M20 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CNBD2Q96M20 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms