Protein–RNA interactions for Protein: Q96JG8

MAGED4, Melanoma-associated antigen D4, humanhuman

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAGED4Q96JG8 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
MAGED4Q96JG8 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
MAGED4Q96JG8 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
MAGED4Q96JG8 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MAGED4Q96JG8 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
MAGED4Q96JG8 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MAGED4Q96JG8 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MAGED4Q96JG8 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
MAGED4Q96JG8 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MAGED4Q96JG8 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MAGED4Q96JG8 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
MAGED4Q96JG8 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
MAGED4Q96JG8 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MAGED4Q96JG8 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MAGED4Q96JG8 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MAGED4Q96JG8 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MAGED4Q96JG8 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MAGED4Q96JG8 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
MAGED4Q96JG8 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MAGED4Q96JG8 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MAGED4Q96JG8 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MAGED4Q96JG8 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MAGED4Q96JG8 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MAGED4Q96JG8 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MAGED4Q96JG8 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MAGED4Q96JG8 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MAGED4Q96JG8 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MAGED4Q96JG8 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MAGED4Q96JG8 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MAGED4Q96JG8 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MAGED4Q96JG8 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MAGED4Q96JG8 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MAGED4Q96JG8 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MAGED4Q96JG8 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
MAGED4Q96JG8 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MAGED4Q96JG8 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MAGED4Q96JG8 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
MAGED4Q96JG8 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MAGED4Q96JG8 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
MAGED4Q96JG8 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
MAGED4Q96JG8 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
MAGED4Q96JG8 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
MAGED4Q96JG8 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MAGED4Q96JG8 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MAGED4Q96JG8 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MAGED4Q96JG8 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MAGED4Q96JG8 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MAGED4Q96JG8 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MAGED4Q96JG8 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MAGED4Q96JG8 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MAGED4Q96JG8 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MAGED4Q96JG8 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MAGED4Q96JG8 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MAGED4Q96JG8 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MAGED4Q96JG8 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MAGED4Q96JG8 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MAGED4Q96JG8 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MAGED4Q96JG8 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MAGED4Q96JG8 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MAGED4Q96JG8 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MAGED4Q96JG8 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MAGED4Q96JG8 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MAGED4Q96JG8 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MAGED4Q96JG8 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MAGED4Q96JG8 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MAGED4Q96JG8 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MAGED4Q96JG8 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
MAGED4Q96JG8 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MAGED4Q96JG8 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MAGED4Q96JG8 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MAGED4Q96JG8 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MAGED4Q96JG8 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MAGED4Q96JG8 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MAGED4Q96JG8 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MAGED4Q96JG8 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MAGED4Q96JG8 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
MAGED4Q96JG8 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
MAGED4Q96JG8 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
MAGED4Q96JG8 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
MAGED4Q96JG8 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MAGED4Q96JG8 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MAGED4Q96JG8 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
MAGED4Q96JG8 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
MAGED4Q96JG8 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
MAGED4Q96JG8 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MAGED4Q96JG8 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MAGED4Q96JG8 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
MAGED4Q96JG8 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MAGED4Q96JG8 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MAGED4Q96JG8 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MAGED4Q96JG8 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
MAGED4Q96JG8 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MAGED4Q96JG8 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MAGED4Q96JG8 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
MAGED4Q96JG8 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
MAGED4Q96JG8 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MAGED4Q96JG8 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MAGED4Q96JG8 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MAGED4Q96JG8 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MAGED4Q96JG8 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms