Protein–RNA interactions for Protein: Q96FN4

CPNE2, Copine-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE2Q96FN4 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CPNE2Q96FN4 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CPNE2Q96FN4 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CPNE2Q96FN4 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CPNE2Q96FN4 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CPNE2Q96FN4 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CPNE2Q96FN4 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CPNE2Q96FN4 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CPNE2Q96FN4 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CPNE2Q96FN4 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CPNE2Q96FN4 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CPNE2Q96FN4 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CPNE2Q96FN4 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CPNE2Q96FN4 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CPNE2Q96FN4 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CPNE2Q96FN4 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CPNE2Q96FN4 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CPNE2Q96FN4 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CPNE2Q96FN4 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CPNE2Q96FN4 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CPNE2Q96FN4 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CPNE2Q96FN4 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CPNE2Q96FN4 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CPNE2Q96FN4 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CPNE2Q96FN4 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CPNE2Q96FN4 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CPNE2Q96FN4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CPNE2Q96FN4 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CPNE2Q96FN4 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CPNE2Q96FN4 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CPNE2Q96FN4 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CPNE2Q96FN4 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CPNE2Q96FN4 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CPNE2Q96FN4 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CPNE2Q96FN4 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CPNE2Q96FN4 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CPNE2Q96FN4 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CPNE2Q96FN4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CPNE2Q96FN4 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CPNE2Q96FN4 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CPNE2Q96FN4 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CPNE2Q96FN4 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CPNE2Q96FN4 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CPNE2Q96FN4 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CPNE2Q96FN4 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CPNE2Q96FN4 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CPNE2Q96FN4 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CPNE2Q96FN4 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CPNE2Q96FN4 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CPNE2Q96FN4 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CPNE2Q96FN4 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CPNE2Q96FN4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CPNE2Q96FN4 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CPNE2Q96FN4 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CPNE2Q96FN4 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CPNE2Q96FN4 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CPNE2Q96FN4 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CPNE2Q96FN4 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CPNE2Q96FN4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CPNE2Q96FN4 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CPNE2Q96FN4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CPNE2Q96FN4 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CPNE2Q96FN4 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CPNE2Q96FN4 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CPNE2Q96FN4 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CPNE2Q96FN4 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CPNE2Q96FN4 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CPNE2Q96FN4 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CPNE2Q96FN4 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CPNE2Q96FN4 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CPNE2Q96FN4 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CPNE2Q96FN4 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CPNE2Q96FN4 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CPNE2Q96FN4 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CPNE2Q96FN4 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CPNE2Q96FN4 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CPNE2Q96FN4 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CPNE2Q96FN4 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CPNE2Q96FN4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CPNE2Q96FN4 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CPNE2Q96FN4 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CPNE2Q96FN4 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CPNE2Q96FN4 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CPNE2Q96FN4 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CPNE2Q96FN4 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CPNE2Q96FN4 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CPNE2Q96FN4 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CPNE2Q96FN4 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CPNE2Q96FN4 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CPNE2Q96FN4 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CPNE2Q96FN4 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CPNE2Q96FN4 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CPNE2Q96FN4 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CPNE2Q96FN4 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CPNE2Q96FN4 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CPNE2Q96FN4 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CPNE2Q96FN4 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CPNE2Q96FN4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CPNE2Q96FN4 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CPNE2Q96FN4 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms