Protein–RNA interactions for Protein: Q96B42

TMEM18, Transmembrane protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM18Q96B42 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM18Q96B42 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM18Q96B42 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM18Q96B42 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM18Q96B42 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM18Q96B42 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM18Q96B42 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM18Q96B42 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM18Q96B42 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEM18Q96B42 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM18Q96B42 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM18Q96B42 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM18Q96B42 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TMEM18Q96B42 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMEM18Q96B42 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMEM18Q96B42 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM18Q96B42 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM18Q96B42 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM18Q96B42 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM18Q96B42 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM18Q96B42 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM18Q96B42 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM18Q96B42 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM18Q96B42 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMEM18Q96B42 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMEM18Q96B42 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM18Q96B42 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM18Q96B42 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM18Q96B42 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM18Q96B42 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM18Q96B42 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM18Q96B42 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM18Q96B42 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM18Q96B42 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM18Q96B42 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMEM18Q96B42 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMEM18Q96B42 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMEM18Q96B42 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMEM18Q96B42 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM18Q96B42 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM18Q96B42 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM18Q96B42 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEM18Q96B42 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM18Q96B42 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM18Q96B42 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEM18Q96B42 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM18Q96B42 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM18Q96B42 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM18Q96B42 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM18Q96B42 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM18Q96B42 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM18Q96B42 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM18Q96B42 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM18Q96B42 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM18Q96B42 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM18Q96B42 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM18Q96B42 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM18Q96B42 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM18Q96B42 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM18Q96B42 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM18Q96B42 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM18Q96B42 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM18Q96B42 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM18Q96B42 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM18Q96B42 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM18Q96B42 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM18Q96B42 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM18Q96B42 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM18Q96B42 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM18Q96B42 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM18Q96B42 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM18Q96B42 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM18Q96B42 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM18Q96B42 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM18Q96B42 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM18Q96B42 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM18Q96B42 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM18Q96B42 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM18Q96B42 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM18Q96B42 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM18Q96B42 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM18Q96B42 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM18Q96B42 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM18Q96B42 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM18Q96B42 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM18Q96B42 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM18Q96B42 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM18Q96B42 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM18Q96B42 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM18Q96B42 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM18Q96B42 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM18Q96B42 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM18Q96B42 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM18Q96B42 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM18Q96B42 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM18Q96B42 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM18Q96B42 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM18Q96B42 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM18Q96B42 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM18Q96B42 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.7 ms