Protein–RNA interactions for Protein: Q92622

RUBCN, Run domain Beclin-1-interacting and cysteine-rich domain-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUBCNQ92622 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
RUBCNQ92622 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
RUBCNQ92622 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
RUBCNQ92622 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
RUBCNQ92622 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
RUBCNQ92622 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
RUBCNQ92622 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC30.66■■■□□ 2.5
RUBCNQ92622 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
RUBCNQ92622 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
RUBCNQ92622 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
RUBCNQ92622 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
RUBCNQ92622 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
RUBCNQ92622 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
RUBCNQ92622 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
RUBCNQ92622 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
RUBCNQ92622 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
RUBCNQ92622 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
RUBCNQ92622 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
RUBCNQ92622 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
RUBCNQ92622 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
RUBCNQ92622 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
RUBCNQ92622 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
RUBCNQ92622 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
RUBCNQ92622 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
RUBCNQ92622 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
RUBCNQ92622 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
RUBCNQ92622 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC30.45■■■□□ 2.47
RUBCNQ92622 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
RUBCNQ92622 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
RUBCNQ92622 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
RUBCNQ92622 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
RUBCNQ92622 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
RUBCNQ92622 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
RUBCNQ92622 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
RUBCNQ92622 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
RUBCNQ92622 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
RUBCNQ92622 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
RUBCNQ92622 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
RUBCNQ92622 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
RUBCNQ92622 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.45
RUBCNQ92622 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
RUBCNQ92622 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
RUBCNQ92622 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
RUBCNQ92622 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
RUBCNQ92622 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
RUBCNQ92622 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
RUBCNQ92622 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
RUBCNQ92622 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
RUBCNQ92622 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC30.21■■■□□ 2.43
RUBCNQ92622 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
RUBCNQ92622 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
RUBCNQ92622 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
RUBCNQ92622 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
RUBCNQ92622 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
RUBCNQ92622 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
RUBCNQ92622 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
RUBCNQ92622 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC30.17■■■□□ 2.42
RUBCNQ92622 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
RUBCNQ92622 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
RUBCNQ92622 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
RUBCNQ92622 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
RUBCNQ92622 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
RUBCNQ92622 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
RUBCNQ92622 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
RUBCNQ92622 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
RUBCNQ92622 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
RUBCNQ92622 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
RUBCNQ92622 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
RUBCNQ92622 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
RUBCNQ92622 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
RUBCNQ92622 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC30.01■■■□□ 2.39
RUBCNQ92622 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
RUBCNQ92622 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
RUBCNQ92622 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC30■■■□□ 2.39
RUBCNQ92622 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
RUBCNQ92622 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
RUBCNQ92622 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
RUBCNQ92622 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
RUBCNQ92622 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
RUBCNQ92622 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
RUBCNQ92622 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
RUBCNQ92622 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
RUBCNQ92622 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
RUBCNQ92622 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
RUBCNQ92622 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
RUBCNQ92622 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
RUBCNQ92622 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
RUBCNQ92622 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
RUBCNQ92622 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
RUBCNQ92622 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
RUBCNQ92622 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
RUBCNQ92622 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
RUBCNQ92622 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
RUBCNQ92622 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
RUBCNQ92622 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
RUBCNQ92622 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
RUBCNQ92622 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
RUBCNQ92622 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
RUBCNQ92622 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
RUBCNQ92622 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms