Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW12

PCNP, PEST proteolytic signal-containing nuclear protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNPQ8WW12 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCNPQ8WW12 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCNPQ8WW12 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCNPQ8WW12 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCNPQ8WW12 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCNPQ8WW12 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCNPQ8WW12 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCNPQ8WW12 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCNPQ8WW12 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCNPQ8WW12 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PCNPQ8WW12 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCNPQ8WW12 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCNPQ8WW12 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PCNPQ8WW12 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PCNPQ8WW12 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PCNPQ8WW12 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCNPQ8WW12 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCNPQ8WW12 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCNPQ8WW12 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCNPQ8WW12 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PCNPQ8WW12 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PCNPQ8WW12 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PCNPQ8WW12 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PCNPQ8WW12 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PCNPQ8WW12 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PCNPQ8WW12 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PCNPQ8WW12 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCNPQ8WW12 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCNPQ8WW12 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PCNPQ8WW12 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PCNPQ8WW12 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PCNPQ8WW12 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PCNPQ8WW12 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PCNPQ8WW12 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PCNPQ8WW12 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PCNPQ8WW12 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PCNPQ8WW12 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PCNPQ8WW12 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PCNPQ8WW12 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PCNPQ8WW12 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PCNPQ8WW12 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PCNPQ8WW12 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PCNPQ8WW12 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCNPQ8WW12 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCNPQ8WW12 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCNPQ8WW12 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PCNPQ8WW12 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PCNPQ8WW12 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCNPQ8WW12 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCNPQ8WW12 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCNPQ8WW12 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCNPQ8WW12 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCNPQ8WW12 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCNPQ8WW12 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCNPQ8WW12 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCNPQ8WW12 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCNPQ8WW12 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCNPQ8WW12 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCNPQ8WW12 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCNPQ8WW12 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCNPQ8WW12 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCNPQ8WW12 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCNPQ8WW12 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCNPQ8WW12 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PCNPQ8WW12 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCNPQ8WW12 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCNPQ8WW12 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCNPQ8WW12 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCNPQ8WW12 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCNPQ8WW12 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PCNPQ8WW12 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCNPQ8WW12 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PCNPQ8WW12 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCNPQ8WW12 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCNPQ8WW12 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCNPQ8WW12 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCNPQ8WW12 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCNPQ8WW12 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCNPQ8WW12 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCNPQ8WW12 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCNPQ8WW12 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCNPQ8WW12 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCNPQ8WW12 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCNPQ8WW12 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCNPQ8WW12 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCNPQ8WW12 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCNPQ8WW12 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCNPQ8WW12 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCNPQ8WW12 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCNPQ8WW12 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCNPQ8WW12 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCNPQ8WW12 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCNPQ8WW12 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCNPQ8WW12 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCNPQ8WW12 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCNPQ8WW12 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCNPQ8WW12 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCNPQ8WW12 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCNPQ8WW12 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCNPQ8WW12 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms