Protein–RNA interactions for Protein: Q86UE3

ZNF546, Zinc finger protein 546, humanhuman

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF546Q86UE3 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF546Q86UE3 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF546Q86UE3 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF546Q86UE3 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF546Q86UE3 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF546Q86UE3 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF546Q86UE3 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF546Q86UE3 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF546Q86UE3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF546Q86UE3 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF546Q86UE3 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF546Q86UE3 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF546Q86UE3 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZNF546Q86UE3 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZNF546Q86UE3 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZNF546Q86UE3 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF546Q86UE3 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF546Q86UE3 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF546Q86UE3 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF546Q86UE3 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF546Q86UE3 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZNF546Q86UE3 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZNF546Q86UE3 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZNF546Q86UE3 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF546Q86UE3 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZNF546Q86UE3 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZNF546Q86UE3 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZNF546Q86UE3 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZNF546Q86UE3 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNF546Q86UE3 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF546Q86UE3 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF546Q86UE3 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF546Q86UE3 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF546Q86UE3 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF546Q86UE3 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF546Q86UE3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF546Q86UE3 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF546Q86UE3 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF546Q86UE3 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF546Q86UE3 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF546Q86UE3 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF546Q86UE3 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF546Q86UE3 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF546Q86UE3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF546Q86UE3 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF546Q86UE3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF546Q86UE3 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF546Q86UE3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF546Q86UE3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF546Q86UE3 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ZNF546Q86UE3 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF546Q86UE3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF546Q86UE3 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF546Q86UE3 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF546Q86UE3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF546Q86UE3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF546Q86UE3 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF546Q86UE3 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF546Q86UE3 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF546Q86UE3 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF546Q86UE3 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF546Q86UE3 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF546Q86UE3 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF546Q86UE3 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF546Q86UE3 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF546Q86UE3 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF546Q86UE3 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF546Q86UE3 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF546Q86UE3 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF546Q86UE3 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF546Q86UE3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF546Q86UE3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ZNF546Q86UE3 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF546Q86UE3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF546Q86UE3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF546Q86UE3 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF546Q86UE3 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF546Q86UE3 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF546Q86UE3 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF546Q86UE3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF546Q86UE3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF546Q86UE3 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF546Q86UE3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF546Q86UE3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF546Q86UE3 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF546Q86UE3 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF546Q86UE3 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF546Q86UE3 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF546Q86UE3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF546Q86UE3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF546Q86UE3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF546Q86UE3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF546Q86UE3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF546Q86UE3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF546Q86UE3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF546Q86UE3 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF546Q86UE3 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF546Q86UE3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF546Q86UE3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF546Q86UE3 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.7 ms