Protein–RNA interactions for Protein: Q7L8A9

VASH1, Vasohibin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VASH1Q7L8A9 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
VASH1Q7L8A9 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
VASH1Q7L8A9 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
VASH1Q7L8A9 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
VASH1Q7L8A9 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
VASH1Q7L8A9 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
VASH1Q7L8A9 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
VASH1Q7L8A9 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
VASH1Q7L8A9 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
VASH1Q7L8A9 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
VASH1Q7L8A9 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
VASH1Q7L8A9 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
VASH1Q7L8A9 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
VASH1Q7L8A9 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
VASH1Q7L8A9 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
VASH1Q7L8A9 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
VASH1Q7L8A9 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
VASH1Q7L8A9 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
VASH1Q7L8A9 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
VASH1Q7L8A9 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
VASH1Q7L8A9 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
VASH1Q7L8A9 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
VASH1Q7L8A9 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
VASH1Q7L8A9 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
VASH1Q7L8A9 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
VASH1Q7L8A9 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
VASH1Q7L8A9 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
VASH1Q7L8A9 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
VASH1Q7L8A9 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
VASH1Q7L8A9 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
VASH1Q7L8A9 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
VASH1Q7L8A9 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
VASH1Q7L8A9 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
VASH1Q7L8A9 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
VASH1Q7L8A9 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
VASH1Q7L8A9 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
VASH1Q7L8A9 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
VASH1Q7L8A9 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
VASH1Q7L8A9 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
VASH1Q7L8A9 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
VASH1Q7L8A9 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
VASH1Q7L8A9 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
VASH1Q7L8A9 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
VASH1Q7L8A9 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
VASH1Q7L8A9 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
VASH1Q7L8A9 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
VASH1Q7L8A9 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
VASH1Q7L8A9 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
VASH1Q7L8A9 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
VASH1Q7L8A9 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
VASH1Q7L8A9 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
VASH1Q7L8A9 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
VASH1Q7L8A9 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
VASH1Q7L8A9 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
VASH1Q7L8A9 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
VASH1Q7L8A9 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
VASH1Q7L8A9 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
VASH1Q7L8A9 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
VASH1Q7L8A9 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VASH1Q7L8A9 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VASH1Q7L8A9 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
VASH1Q7L8A9 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
VASH1Q7L8A9 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
VASH1Q7L8A9 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
VASH1Q7L8A9 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VASH1Q7L8A9 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
VASH1Q7L8A9 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
VASH1Q7L8A9 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
VASH1Q7L8A9 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
VASH1Q7L8A9 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VASH1Q7L8A9 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
VASH1Q7L8A9 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VASH1Q7L8A9 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
VASH1Q7L8A9 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
VASH1Q7L8A9 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
VASH1Q7L8A9 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VASH1Q7L8A9 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VASH1Q7L8A9 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VASH1Q7L8A9 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VASH1Q7L8A9 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
VASH1Q7L8A9 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VASH1Q7L8A9 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VASH1Q7L8A9 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
VASH1Q7L8A9 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VASH1Q7L8A9 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VASH1Q7L8A9 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
VASH1Q7L8A9 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
VASH1Q7L8A9 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
VASH1Q7L8A9 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
VASH1Q7L8A9 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VASH1Q7L8A9 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VASH1Q7L8A9 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VASH1Q7L8A9 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VASH1Q7L8A9 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VASH1Q7L8A9 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
VASH1Q7L8A9 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VASH1Q7L8A9 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
VASH1Q7L8A9 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VASH1Q7L8A9 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
VASH1Q7L8A9 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms